More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3743 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3743  inositol monophosphatase family protein  100 
 
 
257 aa  523  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2717  histidinol-phosphate phosphatase, putative  68.63 
 
 
288 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0198902  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3622  histidinol-phosphate phosphatase  68.63 
 
 
257 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0511822  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3323  histidinol-phosphate phosphatase  67.84 
 
 
257 aa  364  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4282  histidinol-phosphate phosphatase, putative  52.71 
 
 
260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0043  inositol monophosphatase family protein  54.3 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.384486  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0045  inositol monophosphatase family protein  53.91 
 
 
258 aa  271  7e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51545  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2818  histidinol-phosphate phosphatase, putative  53.6 
 
 
260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130997  normal  0.176986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0973  histidinol-phosphate phosphatase  53.6 
 
 
260 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782489  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2748  histidinol-phosphate phosphatase, putative  56.3 
 
 
259 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0337561  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1141  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  52.4 
 
 
275 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4517  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  52.8 
 
 
260 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.158706  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5075  histidinol-phosphate phosphatase  51.81 
 
 
263 aa  262  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4358  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  52.4 
 
 
260 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0029628  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3642  histidinol-phosphate phosphatase  50.59 
 
 
267 aa  261  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000362348  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1876  histidinol-phosphate phosphatase  50.19 
 
 
263 aa  260  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2139  histidinol-phosphate phosphatase  51.98 
 
 
262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261779  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2950  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  52.23 
 
 
261 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4559  histidinol-phosphate phosphatase  49.41 
 
 
263 aa  255  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0522743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5019  histidinol-phosphate phosphatase  49.41 
 
 
263 aa  255  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.317763  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1791  histidinol-phosphate phosphatase  50.39 
 
 
270 aa  255  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0779  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  50.6 
 
 
261 aa  254  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.441761 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2138  histidinol-phosphate phosphatase  49.42 
 
 
266 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625466  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2480  histidinol-phosphate phosphatase  49.03 
 
 
265 aa  248  9e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2697  histidinol-phosphate phosphatase  50.79 
 
 
263 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1389  putative inositol monophosphatase family protein  52.03 
 
 
261 aa  244  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000213319  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3252  histidinol-phosphate phosphatase  48.63 
 
 
265 aa  240  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.714931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2557  histidinol-phosphate phosphatase, putative  52.12 
 
 
263 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2889  histidinol-phosphate phosphatase  50.99 
 
 
263 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.796941  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1769  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  49.2 
 
 
263 aa  238  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0758104  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3157  inositol monophosphatase family protein  51.27 
 
 
263 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1982  histidinol-phosphate phosphatase, putative  50.2 
 
 
268 aa  234  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.655024  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2956  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  47.77 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0412  histidinol-phosphate phosphatase  49.6 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1726  histidinol-phosphate phosphatase  51.98 
 
 
262 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64566  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2774  putative inositol-1-monophosphatase  48.19 
 
 
273 aa  225  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2504  histidinol-phosphate phosphatase, putative  46.28 
 
 
265 aa  220  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1907  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  48.1 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1387  inositol monophosphatase  47.15 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1233  inositol monophosphatase  47.26 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1893  inositol monophosphatase family protein  46.22 
 
 
266 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0541  inositol monophosphatase  45.8 
 
 
266 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0676  inositol monophosphatase  45.73 
 
 
266 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00406326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3749  histidinol-phosphate phosphatase  45.23 
 
 
268 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.354046 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1220  histidinol-phosphate phosphatase  41.92 
 
 
278 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427245  normal  0.220917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4044  histidinol-phosphate phosphatase  44.81 
 
 
268 aa  193  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4004  histidinol-phosphate phosphatase  45.61 
 
 
264 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0730713  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2598  putative inositol monophosphatase family protein  41.43 
 
 
262 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3165  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  42.86 
 
 
263 aa  188  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31726  predicted protein  40.53 
 
 
283 aa  186  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.11303  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0980  histidinol-phosphate phosphatase  42.5 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2434  histidinol-phosphate phosphatase, putative  42.63 
 
 
254 aa  178  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.024617  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0099  inositol monophosphatase  39.68 
 
 
264 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110645  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1450  inositol monophosphatase family protein  39.29 
 
 
264 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2941  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  42.28 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0645  inositol monophosphatase  43.46 
 
 
256 aa  168  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0099  inositol monophosphatase  39.33 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.151239  normal  0.110896 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2147  inositol monophosphatase  37.15 
 
 
268 aa  161  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5476  histidinol-phosphate phosphatase, putative  42.33 
 
 
224 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6965  inositol monophosphatase  39.92 
 
 
264 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751878  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1522  inositol monophosphatase  40.61 
 
 
278 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6307  inositol monophosphatase  40.61 
 
 
278 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322034 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4914  inositol monophosphatase  35.66 
 
 
269 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7657  inositol monophosphatase  37.95 
 
 
274 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0980  inositol monophosphatase  38.91 
 
 
262 aa  148  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0975  inositol monophosphatase  40.27 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1683  Inositol-phosphate phosphatase  37.33 
 
 
264 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.510755  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0280  histidinol-phosphate phosphatase  34.55 
 
 
266 aa  142  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0307412  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05970  histidinol-phosphate phosphatase  35.8 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591537 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0948  histidinol-phosphate phosphatase  36.25 
 
 
256 aa  135  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50509  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4319  histidinol-phosphate phosphatase, putative  33.85 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.273658  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2655  histidinol-phosphate phosphatase  35.44 
 
 
270 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0892924  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2388  histidinol-phosphate phosphatase  34.78 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000646571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0430  inositol monophosphatase  36.04 
 
 
274 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6379  histidinol-phosphate phosphatase  36.51 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1497  inositol monophosphatase  35.24 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1470  inositol monophosphatase  35.24 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1799  histidinol-phosphate phosphatase  34.11 
 
 
258 aa  126  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2305  inositol monophosphatase  32.34 
 
 
270 aa  123  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.209842  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4101  histidinol-phosphate phosphatase, putative  37.29 
 
 
272 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0945  histidinol-phosphate phosphatase, putative  32.42 
 
 
257 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0589084  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3720  histidinol-phosphate phosphatase, putative  39.2 
 
 
272 aa  122  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0890  histidinol-phosphate phosphatase  31.58 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3700  histidinol-phosphate phosphatase, putative  30.8 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000574664  normal  0.0324911 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0929  histidinol-phosphate phosphatase  34.13 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.419149  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1522  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  30.83 
 
 
261 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1430  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  33.33 
 
 
255 aa  119  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1261  histidinol-phosphate phosphatase  34.02 
 
 
274 aa  118  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal  0.185517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09450  histidinol-phosphate phosphatase  32.47 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0955  histidinol-phosphate phosphatase, putative  32.46 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2478  inositol monophosphatase  34.89 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.138875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3718  histidinol-phosphate phosphatase  34.55 
 
 
280 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0865715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8330  histidinol-phosphate phosphatase  31.93 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1206  histidinol-phosphate phosphatase, putative  35.45 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07670  histidinol-phosphate phosphatase  34.02 
 
 
282 aa  112  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0159445  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2586  Inositol-phosphate phosphatase  34.36 
 
 
260 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000081525 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2248  inositol monophosphatase  34.1 
 
 
259 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.24134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2496  histidinol-phosphate phosphatase  33.19 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377146  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3773  histidinol-phosphate phosphatase  32.02 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1575  histidinol-phosphate phosphatase  32.2 
 
 
265 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>