More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2697 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2697  histidinol-phosphate phosphatase  100 
 
 		 263 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2557  histidinol-phosphate phosphatase, putative  96.2 
 
 		 263 aa  497  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2889  histidinol-phosphate phosphatase  92.78 
 
 		 263 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.796941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3157  inositol monophosphatase family protein  93.54 
 
 		 263 aa  487  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2956  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  70.98 
 
 		 259 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1769  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  63.71 
 
 		 263 aa  345  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0758104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1982  histidinol-phosphate phosphatase, putative  55.09 
 
 		 268 aa  288  4e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0973  histidinol-phosphate phosphatase  51.17 
 
 		 260 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782489  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4358  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  50.78 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0029628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2818  histidinol-phosphate phosphatase, putative  52.34 
 
 		 260 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130997  normal  0.176986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4517  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  50.78 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.158706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2139  histidinol-phosphate phosphatase  51.56 
 
 		 262 aa  255  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261779  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0779  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  48.64 
 
 		 261 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.441761 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1141  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  49.42 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3743  inositol monophosphatase family protein  50.79 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2950  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  50.39 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5019  histidinol-phosphate phosphatase  49.41 
 
 		 263 aa  247  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.317763  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4559  histidinol-phosphate phosphatase  49.41 
 
 		 263 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0522743 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3642  histidinol-phosphate phosphatase  49.24 
 
 		 267 aa  247  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000362348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5075  histidinol-phosphate phosphatase  50.19 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3622  histidinol-phosphate phosphatase  46.46 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0511822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1389  putative inositol monophosphatase family protein  49.02 
 
 		 261 aa  241  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000213319  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3323  histidinol-phosphate phosphatase  45.28 
 
 		 257 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2717  histidinol-phosphate phosphatase, putative  47.15 
 
 		 288 aa  240  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0198902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0412  histidinol-phosphate phosphatase  49.22 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3252  histidinol-phosphate phosphatase  49.23 
 
 		 265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.714931 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2504  histidinol-phosphate phosphatase, putative  53.41 
 
 		 265 aa  238  5e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2774  putative inositol-1-monophosphatase  50.59 
 
 		 273 aa  229  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1387  inositol monophosphatase  50.2 
 
 		 271 aa  228  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1726  histidinol-phosphate phosphatase  48.64 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2598  putative inositol monophosphatase family protein  47.13 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4282  histidinol-phosphate phosphatase, putative  50 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2748  histidinol-phosphate phosphatase, putative  49.4 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0337561  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0045  inositol monophosphatase family protein  50 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51545  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1907  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  47.93 
 
 		 264 aa  222  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2480  histidinol-phosphate phosphatase  47.84 
 
 		 265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0676  inositol monophosphatase  48.95 
 
 		 266 aa  221  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00406326 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2138  histidinol-phosphate phosphatase  47.84 
 
 		 266 aa  221  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625466  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1233  inositol monophosphatase  48.33 
 
 		 265 aa  221  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0043  inositol monophosphatase family protein  50 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.384486  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1893  inositol monophosphatase family protein  48.55 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1791  histidinol-phosphate phosphatase  46.67 
 
 		 270 aa  219  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1220  histidinol-phosphate phosphatase  44.77 
 
 		 278 aa  218  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427245  normal  0.220917 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0541  inositol monophosphatase  47.72 
 
 		 266 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31726  predicted protein  44.07 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.11303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1876  histidinol-phosphate phosphatase  44.88 
 
 		 263 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4004  histidinol-phosphate phosphatase  47.28 
 
 		 264 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0730713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3749  histidinol-phosphate phosphatase  46.84 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.354046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4044  histidinol-phosphate phosphatase  46.41 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2434  histidinol-phosphate phosphatase, putative  46.18 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.024617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2941  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  46.61 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0980  histidinol-phosphate phosphatase  44.87 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0645  inositol monophosphatase  46.25 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0099  inositol monophosphatase  44.21 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.151239  normal  0.110896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3165  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  43.41 
 
 		 263 aa  191  8e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0975  inositol monophosphatase  47.28 
 
 		 259 aa  191  9e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0099  inositol monophosphatase  40.23 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110645  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1450  inositol monophosphatase family protein  40.23 
 
 		 264 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0280  histidinol-phosphate phosphatase  37.2 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0307412  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4914  inositol monophosphatase  38.19 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5476  histidinol-phosphate phosphatase, putative  43.78 
 
 		 224 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2147  inositol monophosphatase  37.98 
 
 		 268 aa  165  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6965  inositol monophosphatase  40.23 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1683  Inositol-phosphate phosphatase  41.01 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.510755  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1470  inositol monophosphatase  38.08 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0430  inositol monophosphatase  37.55 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1497  inositol monophosphatase  38.08 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1522  inositol monophosphatase  39.53 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6307  inositol monophosphatase  39.53 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.322034 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7657  inositol monophosphatase  37.01 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3700  histidinol-phosphate phosphatase, putative  33.46 
 
 		 258 aa  151  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000574664  normal  0.0324911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0980  inositol monophosphatase  40.42 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0945  histidinol-phosphate phosphatase, putative  33.2 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0589084  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0647  Inositol-phosphate phosphatase  35.25 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2586  Inositol-phosphate phosphatase  38.49 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000081525 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4319  histidinol-phosphate phosphatase, putative  35.78 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.273658  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1522  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  32.8 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4101  histidinol-phosphate phosphatase, putative  38.43 
 
 		 272 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3720  histidinol-phosphate phosphatase, putative  39.74 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0948  histidinol-phosphate phosphatase  35.89 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6379  histidinol-phosphate phosphatase  38.67 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05970  histidinol-phosphate phosphatase  34.92 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1542  histidinol-phosphate phosphatase  35.47 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267897 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2305  inositol monophosphatase  34.36 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.209842  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2655  histidinol-phosphate phosphatase  34.46 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0892924  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2388  histidinol-phosphate phosphatase  36.22 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000646571 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1799  histidinol-phosphate phosphatase  36.32 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1430  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  33.77 
 
 		 255 aa  128  9.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0929  histidinol-phosphate phosphatase  34.32 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.419149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09450  histidinol-phosphate phosphatase  35.37 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0542  histidinol-phosphate phosphatase  33.6 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8330  histidinol-phosphate phosphatase  32.81 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1206  histidinol-phosphate phosphatase, putative  37.14 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3027  histidinol-phosphate phosphatase  37.1 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2248  inositol monophosphatase  33.05 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.24134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2929  histidinol-phosphate phosphatase  36.76 
 
 		 264 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0890  histidinol-phosphate phosphatase  30.04 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4200  histidinol-phosphate phosphatase  34.12 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1205  histidinol-phosphate phosphatase  34.78 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2496  histidinol-phosphate phosphatase  33.6 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>