More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1387 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1387  inositol monophosphatase  100 
 
 
271 aa  541  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2774  putative inositol-1-monophosphatase  64.73 
 
 
273 aa  329  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1233  inositol monophosphatase  63.98 
 
 
265 aa  302  5.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1907  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  61.7 
 
 
264 aa  296  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1893  inositol monophosphatase family protein  59.58 
 
 
266 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0541  inositol monophosphatase  59.17 
 
 
266 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0676  inositol monophosphatase  58.05 
 
 
266 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00406326 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1141  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  48.03 
 
 
275 aa  239  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2717  histidinol-phosphate phosphatase, putative  51.2 
 
 
288 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0198902  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2504  histidinol-phosphate phosphatase, putative  53.01 
 
 
265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2950  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  46.88 
 
 
261 aa  232  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4358  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  46.64 
 
 
260 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0029628  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3642  histidinol-phosphate phosphatase  47.51 
 
 
267 aa  229  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000362348  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4517  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  47.64 
 
 
260 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.158706  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2697  histidinol-phosphate phosphatase  50.2 
 
 
263 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1769  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  51.57 
 
 
263 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0758104  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4559  histidinol-phosphate phosphatase  49.2 
 
 
263 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0522743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3622  histidinol-phosphate phosphatase  47.39 
 
 
257 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0511822  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5019  histidinol-phosphate phosphatase  49.2 
 
 
263 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.317763  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3323  histidinol-phosphate phosphatase  47.39 
 
 
257 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0973  histidinol-phosphate phosphatase  45.85 
 
 
260 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2818  histidinol-phosphate phosphatase, putative  47.41 
 
 
260 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130997  normal  0.176986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1982  histidinol-phosphate phosphatase, putative  49.79 
 
 
268 aa  223  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.655024  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3252  histidinol-phosphate phosphatase  47.71 
 
 
265 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.714931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0779  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  46.69 
 
 
261 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.441761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5075  histidinol-phosphate phosphatase  50 
 
 
263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2889  histidinol-phosphate phosphatase  49.41 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.796941  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2557  histidinol-phosphate phosphatase, putative  50.85 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3157  inositol monophosphatase family protein  50.85 
 
 
263 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2139  histidinol-phosphate phosphatase  49.2 
 
 
262 aa  219  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261779  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0412  histidinol-phosphate phosphatase  49.8 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1389  putative inositol monophosphatase family protein  48.39 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000213319  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1726  histidinol-phosphate phosphatase  52 
 
 
262 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64566  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4282  histidinol-phosphate phosphatase, putative  47.54 
 
 
260 aa  215  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3743  inositol monophosphatase family protein  47.15 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2956  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  47.41 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0045  inositol monophosphatase family protein  47.3 
 
 
258 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0043  inositol monophosphatase family protein  46.89 
 
 
258 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.384486  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2748  histidinol-phosphate phosphatase, putative  47.79 
 
 
259 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0337561  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1791  histidinol-phosphate phosphatase  46.51 
 
 
270 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1876  histidinol-phosphate phosphatase  45.53 
 
 
263 aa  205  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0980  histidinol-phosphate phosphatase  44.81 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2138  histidinol-phosphate phosphatase  43.58 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625466  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2480  histidinol-phosphate phosphatase  42.8 
 
 
265 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4004  histidinol-phosphate phosphatase  45.83 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0730713  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2434  histidinol-phosphate phosphatase, putative  44.31 
 
 
254 aa  195  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.024617  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3749  histidinol-phosphate phosphatase  44.4 
 
 
268 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.354046 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1220  histidinol-phosphate phosphatase  47.37 
 
 
278 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427245  normal  0.220917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4044  histidinol-phosphate phosphatase  44.4 
 
 
268 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2598  putative inositol monophosphatase family protein  41.22 
 
 
262 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3165  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  44.19 
 
 
263 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2941  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  43.44 
 
 
260 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31726  predicted protein  39.06 
 
 
283 aa  170  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.11303  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0645  inositol monophosphatase  43.53 
 
 
256 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0980  inositol monophosphatase  44.2 
 
 
262 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0975  inositol monophosphatase  45.24 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0099  inositol monophosphatase  40.82 
 
 
264 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110645  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6965  inositol monophosphatase  41.78 
 
 
264 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751878  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0099  inositol monophosphatase  43.48 
 
 
274 aa  158  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.151239  normal  0.110896 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1450  inositol monophosphatase family protein  40.56 
 
 
264 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1522  inositol monophosphatase  40.89 
 
 
278 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6307  inositol monophosphatase  40.89 
 
 
278 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322034 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0280  histidinol-phosphate phosphatase  37.35 
 
 
266 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0307412  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1683  Inositol-phosphate phosphatase  37.94 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.510755  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7657  inositol monophosphatase  38.22 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2305  inositol monophosphatase  35.04 
 
 
270 aa  145  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.209842  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2147  inositol monophosphatase  36.78 
 
 
268 aa  143  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5476  histidinol-phosphate phosphatase, putative  36.99 
 
 
224 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1497  inositol monophosphatase  32.95 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1470  inositol monophosphatase  32.95 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4914  inositol monophosphatase  34.06 
 
 
269 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0542  histidinol-phosphate phosphatase  36.82 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05970  histidinol-phosphate phosphatase  37.5 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0430  inositol monophosphatase  34.11 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2655  histidinol-phosphate phosphatase  33.83 
 
 
270 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0892924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2586  Inositol-phosphate phosphatase  35.74 
 
 
260 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000081525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8330  histidinol-phosphate phosphatase  34.88 
 
 
267 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3720  histidinol-phosphate phosphatase, putative  39.02 
 
 
272 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6379  histidinol-phosphate phosphatase  40 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2388  histidinol-phosphate phosphatase  35.41 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000646571 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1542  histidinol-phosphate phosphatase  35.53 
 
 
253 aa  130  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267897 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1522  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  31.32 
 
 
261 aa  130  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4101  histidinol-phosphate phosphatase, putative  37.05 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4200  histidinol-phosphate phosphatase  37.74 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3700  histidinol-phosphate phosphatase, putative  35.39 
 
 
258 aa  122  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000574664  normal  0.0324911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0945  histidinol-phosphate phosphatase, putative  34.71 
 
 
257 aa  122  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0589084  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0948  histidinol-phosphate phosphatase  32.1 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50509  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1430  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  33.48 
 
 
255 aa  119  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3718  histidinol-phosphate phosphatase  36.4 
 
 
280 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0865715  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1799  histidinol-phosphate phosphatase  34.71 
 
 
258 aa  118  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4319  histidinol-phosphate phosphatase, putative  35 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.273658  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07670  histidinol-phosphate phosphatase  34.1 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0159445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1396  histidinol-phosphate phosphatase  33.59 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.305327  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0533  histidinol-phosphate phosphatase  34.43 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.389982  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1629  histidinol-phosphate phosphatase  33.97 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0929  histidinol-phosphate phosphatase  35.19 
 
 
252 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.419149  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1605  histidinol-phosphate phosphatase  33.97 
 
 
342 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5194  histidinol-phosphate phosphatase  36.19 
 
 
266 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.248199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1575  histidinol-phosphate phosphatase  33.97 
 
 
265 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1261  histidinol-phosphate phosphatase  35.63 
 
 
274 aa  115  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal  0.185517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>