More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3773 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3773  histidinol-phosphate phosphatase  100 
 
 
316 aa  630  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0955  histidinol-phosphate phosphatase, putative  85.25 
 
 
280 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2655  histidinol-phosphate phosphatase  58.82 
 
 
270 aa  295  8e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0892924  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2388  histidinol-phosphate phosphatase  59.22 
 
 
270 aa  294  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000646571 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09450  histidinol-phosphate phosphatase  59.29 
 
 
266 aa  293  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3718  histidinol-phosphate phosphatase  61.48 
 
 
280 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0865715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8330  histidinol-phosphate phosphatase  58.59 
 
 
267 aa  288  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4200  histidinol-phosphate phosphatase  60 
 
 
268 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1396  histidinol-phosphate phosphatase  56.49 
 
 
267 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.305327  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2496  histidinol-phosphate phosphatase  57.77 
 
 
260 aa  279  6e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377146  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1697  histidinol-phosphate phosphatase  59.36 
 
 
291 aa  278  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.893079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0542  histidinol-phosphate phosphatase  55.6 
 
 
268 aa  276  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1206  histidinol-phosphate phosphatase, putative  57.37 
 
 
275 aa  276  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2929  histidinol-phosphate phosphatase  60 
 
 
264 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1908  histidinol-phosphate phosphatase, putative  54.86 
 
 
259 aa  272  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1261  histidinol-phosphate phosphatase  55.29 
 
 
274 aa  270  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal  0.185517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1205  histidinol-phosphate phosphatase  56.76 
 
 
259 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1814  histidinol-phosphate phosphatase  58.47 
 
 
265 aa  268  7e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19490  histidinol-phosphate phosphatase  55.34 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3458  histidinol-phosphate phosphatase  53.79 
 
 
266 aa  265  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.311425  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05970  histidinol-phosphate phosphatase  54.98 
 
 
270 aa  263  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1575  histidinol-phosphate phosphatase  55.51 
 
 
265 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1605  histidinol-phosphate phosphatase  55.51 
 
 
342 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1629  histidinol-phosphate phosphatase  55.51 
 
 
265 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4454  histidinol-phosphate phosphatase, putative  55.81 
 
 
259 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6379  histidinol-phosphate phosphatase  55.25 
 
 
280 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07670  histidinol-phosphate phosphatase  54.04 
 
 
282 aa  257  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0159445  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13158  monophosphatase  56.08 
 
 
260 aa  255  6e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0533  histidinol-phosphate phosphatase  55.74 
 
 
265 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.389982  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5194  histidinol-phosphate phosphatase  51.34 
 
 
266 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.248199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3789  histidinol-phosphate phosphatase  53.46 
 
 
279 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3720  histidinol-phosphate phosphatase, putative  51.54 
 
 
272 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4101  histidinol-phosphate phosphatase, putative  51.22 
 
 
272 aa  236  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3027  histidinol-phosphate phosphatase  53.62 
 
 
265 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36394  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1676  histidinol-phosphate phosphatase  55.24 
 
 
270 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00393257  normal  0.332197 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2305  inositol monophosphatase  37.26 
 
 
270 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.209842  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0948  histidinol-phosphate phosphatase  38.56 
 
 
256 aa  159  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50509  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1430  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  37.01 
 
 
255 aa  158  9e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0647  Inositol-phosphate phosphatase  38.7 
 
 
255 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0929  histidinol-phosphate phosphatase  37.9 
 
 
252 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.419149  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2478  inositol monophosphatase  39.77 
 
 
263 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.138875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3700  histidinol-phosphate phosphatase, putative  40.64 
 
 
258 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000574664  normal  0.0324911 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1522  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  36.61 
 
 
261 aa  155  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1542  histidinol-phosphate phosphatase  38.08 
 
 
253 aa  154  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0945  histidinol-phosphate phosphatase, putative  39.68 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0589084  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1791  histidinol-phosphate phosphatase  39.85 
 
 
270 aa  152  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1799  histidinol-phosphate phosphatase  40 
 
 
258 aa  152  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1876  histidinol-phosphate phosphatase  39.46 
 
 
263 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2586  Inositol-phosphate phosphatase  40.17 
 
 
260 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000081525 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2573  Inositol-phosphate phosphatase  38.96 
 
 
263 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2669  inositol monophosphatase  38.53 
 
 
263 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.751765  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0890  histidinol-phosphate phosphatase  35.8 
 
 
259 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5214  inositol monophosphatase  40.61 
 
 
267 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2248  inositol monophosphatase  36.36 
 
 
259 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.24134 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1287  histidinol-phosphate phosphatase  37.66 
 
 
263 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00562099  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2138  histidinol-phosphate phosphatase  36.64 
 
 
266 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625466  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4319  histidinol-phosphate phosphatase, putative  35.74 
 
 
258 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.273658  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2480  histidinol-phosphate phosphatase  36.26 
 
 
265 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1217  inositol monophosphatase  36.87 
 
 
256 aa  132  9e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.413525  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1141  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  33.09 
 
 
275 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2941  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  37.71 
 
 
260 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2139  histidinol-phosphate phosphatase  35.46 
 
 
262 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261779  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2950  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  33.71 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31726  predicted protein  36.05 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.11303  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0695  histidinol-phosphate phosphatase  38.36 
 
 
259 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1992  inositol monophosphatase  33.09 
 
 
285 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0120097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3323  histidinol-phosphate phosphatase  32.5 
 
 
257 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4559  histidinol-phosphate phosphatase  35.29 
 
 
263 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0522743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5019  histidinol-phosphate phosphatase  35.29 
 
 
263 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.317763  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0779  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  32.71 
 
 
261 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.441761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2598  putative inositol monophosphatase family protein  33.85 
 
 
262 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2434  histidinol-phosphate phosphatase, putative  36.36 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.024617  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0676  inositol monophosphatase  32.64 
 
 
266 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00406326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0980  histidinol-phosphate phosphatase  35.94 
 
 
258 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1028  inositol monophosphatase  33.48 
 
 
269 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00157763  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2717  histidinol-phosphate phosphatase, putative  33.86 
 
 
288 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0198902  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0099  inositol monophosphatase  36.09 
 
 
274 aa  119  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.151239  normal  0.110896 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1450  inositol monophosphatase family protein  34.89 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3642  histidinol-phosphate phosphatase  33.09 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000362348  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4517  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  33.2 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.158706  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5075  histidinol-phosphate phosphatase  34.39 
 
 
263 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3622  histidinol-phosphate phosphatase  31.25 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0511822  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0099  inositol monophosphatase  34.89 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110645  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2147  inositol monophosphatase  34.06 
 
 
268 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0045  inositol monophosphatase family protein  35.86 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51545  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0973  histidinol-phosphate phosphatase  32.51 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782489  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3743  inositol monophosphatase family protein  32.91 
 
 
257 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4358  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  32.79 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0029628  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0043  inositol monophosphatase family protein  35.44 
 
 
258 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.384486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1389  putative inositol monophosphatase family protein  32.31 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000213319  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2956  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  32.35 
 
 
259 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1893  inositol monophosphatase family protein  32.65 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0280  histidinol-phosphate phosphatase  32.03 
 
 
266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0307412  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3252  histidinol-phosphate phosphatase  34.67 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.714931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0975  inositol monophosphatase  36.27 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1692  inositol monophosphatase  36.84 
 
 
269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0645  inositol monophosphatase  36.14 
 
 
256 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2504  histidinol-phosphate phosphatase, putative  33.77 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2818  histidinol-phosphate phosphatase, putative  36.99 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130997  normal  0.176986 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1387  inositol monophosphatase  33.72 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>