More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5476 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5476  histidinol-phosphate phosphatase, putative  100 
 
 
224 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1683  Inositol-phosphate phosphatase  51.8 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.510755  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4914  inositol monophosphatase  47.49 
 
 
269 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2598  putative inositol monophosphatase family protein  49.77 
 
 
262 aa  211  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2434  histidinol-phosphate phosphatase, putative  45.7 
 
 
254 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.024617  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0099  inositol monophosphatase  45.5 
 
 
264 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110645  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1450  inositol monophosphatase family protein  45.05 
 
 
264 aa  201  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3165  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  47.09 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0980  histidinol-phosphate phosphatase  43.3 
 
 
258 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3749  histidinol-phosphate phosphatase  45.13 
 
 
268 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.354046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4044  histidinol-phosphate phosphatase  45.58 
 
 
268 aa  189  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2941  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  42.22 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31726  predicted protein  43.14 
 
 
283 aa  186  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.11303  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4004  histidinol-phosphate phosphatase  44.69 
 
 
264 aa  185  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0730713  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0099  inositol monophosphatase  43.3 
 
 
274 aa  182  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.151239  normal  0.110896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5019  histidinol-phosphate phosphatase  42.99 
 
 
263 aa  182  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.317763  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4559  histidinol-phosphate phosphatase  42.99 
 
 
263 aa  182  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0522743 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2139  histidinol-phosphate phosphatase  44.8 
 
 
262 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261779  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5075  histidinol-phosphate phosphatase  42.99 
 
 
263 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0645  inositol monophosphatase  46.05 
 
 
256 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4517  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  42.86 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.158706  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0975  inositol monophosphatase  42.86 
 
 
259 aa  178  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2557  histidinol-phosphate phosphatase, putative  44.7 
 
 
263 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3157  inositol monophosphatase family protein  43.78 
 
 
263 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2697  histidinol-phosphate phosphatase  43.78 
 
 
263 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2717  histidinol-phosphate phosphatase, putative  43.38 
 
 
288 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0198902  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2950  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  40.52 
 
 
261 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0973  histidinol-phosphate phosphatase  41.96 
 
 
260 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782489  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2889  histidinol-phosphate phosphatase  42.86 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.796941  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4358  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  41.41 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0029628  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1141  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  39.82 
 
 
275 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0779  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  40.64 
 
 
261 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.441761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2956  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  41.01 
 
 
259 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1389  putative inositol monophosphatase family protein  39.82 
 
 
261 aa  168  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000213319  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0280  histidinol-phosphate phosphatase  42.15 
 
 
266 aa  168  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0307412  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3743  inositol monophosphatase family protein  42.33 
 
 
257 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4282  histidinol-phosphate phosphatase, putative  41.96 
 
 
260 aa  165  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3622  histidinol-phosphate phosphatase  38.71 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0511822  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3323  histidinol-phosphate phosphatase  39.64 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1982  histidinol-phosphate phosphatase, putative  41.18 
 
 
268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.655024  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2504  histidinol-phosphate phosphatase, putative  42.08 
 
 
265 aa  162  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0045  inositol monophosphatase family protein  41.82 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51545  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2748  histidinol-phosphate phosphatase, putative  42.22 
 
 
259 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0337561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2818  histidinol-phosphate phosphatase, putative  41.82 
 
 
260 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130997  normal  0.176986 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0043  inositol monophosphatase family protein  41.36 
 
 
258 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.384486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1220  histidinol-phosphate phosphatase  40.78 
 
 
278 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427245  normal  0.220917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0412  histidinol-phosphate phosphatase  44.34 
 
 
262 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3642  histidinol-phosphate phosphatase  39.56 
 
 
267 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000362348  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3252  histidinol-phosphate phosphatase  39.29 
 
 
265 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.714931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2138  histidinol-phosphate phosphatase  39.81 
 
 
266 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625466  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2147  inositol monophosphatase  39.82 
 
 
268 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1522  inositol monophosphatase  38.86 
 
 
278 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6307  inositol monophosphatase  38.86 
 
 
278 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322034 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2774  putative inositol-1-monophosphatase  38.18 
 
 
273 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2480  histidinol-phosphate phosphatase  39.81 
 
 
265 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1726  histidinol-phosphate phosphatase  43.44 
 
 
262 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64566  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6965  inositol monophosphatase  39.21 
 
 
264 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751878  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1769  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  39.63 
 
 
263 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0758104  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1233  inositol monophosphatase  37.79 
 
 
265 aa  148  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1387  inositol monophosphatase  37.9 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1907  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  37.44 
 
 
264 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1876  histidinol-phosphate phosphatase  36.82 
 
 
263 aa  145  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1791  histidinol-phosphate phosphatase  36.65 
 
 
270 aa  141  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7657  inositol monophosphatase  35.71 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0980  inositol monophosphatase  41.26 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1893  inositol monophosphatase family protein  36.53 
 
 
266 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0948  histidinol-phosphate phosphatase  37.17 
 
 
256 aa  138  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50509  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0541  inositol monophosphatase  36.07 
 
 
266 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0676  inositol monophosphatase  34.25 
 
 
266 aa  134  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00406326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4101  histidinol-phosphate phosphatase, putative  39.83 
 
 
272 aa  134  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2248  inositol monophosphatase  35.19 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.24134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3700  histidinol-phosphate phosphatase, putative  36.36 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000574664  normal  0.0324911 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1522  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  34.98 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1470  inositol monophosphatase  33.63 
 
 
269 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1497  inositol monophosphatase  33.63 
 
 
269 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2586  Inositol-phosphate phosphatase  36.87 
 
 
260 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000081525 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4319  histidinol-phosphate phosphatase, putative  33.78 
 
 
258 aa  131  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.273658  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0945  histidinol-phosphate phosphatase, putative  37.56 
 
 
257 aa  131  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0589084  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3720  histidinol-phosphate phosphatase, putative  37.5 
 
 
272 aa  129  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1799  histidinol-phosphate phosphatase  35.71 
 
 
258 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2655  histidinol-phosphate phosphatase  36.96 
 
 
270 aa  128  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0892924  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2388  histidinol-phosphate phosphatase  35.81 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000646571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0430  inositol monophosphatase  33.48 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0890  histidinol-phosphate phosphatase  32.68 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1217  inositol monophosphatase  32.59 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.413525  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3027  histidinol-phosphate phosphatase  36.24 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36394  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05970  histidinol-phosphate phosphatase  34.38 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591537 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0533  histidinol-phosphate phosphatase  36.12 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.389982  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09450  histidinol-phosphate phosphatase  35.96 
 
 
266 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1542  histidinol-phosphate phosphatase  33.97 
 
 
253 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267897 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  36.62 
 
 
266 aa  115  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0929  histidinol-phosphate phosphatase  32.84 
 
 
252 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.419149  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2305  inositol monophosphatase  31.93 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.209842  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3216  inositol-phosphate phosphatase  33.94 
 
 
263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1430  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  31.7 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1908  histidinol-phosphate phosphatase, putative  35.65 
 
 
259 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19490  histidinol-phosphate phosphatase  37.12 
 
 
264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8330  histidinol-phosphate phosphatase  35.09 
 
 
267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2496  histidinol-phosphate phosphatase  34.51 
 
 
260 aa  112  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3458  histidinol-phosphate phosphatase  36.68 
 
 
266 aa  111  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.311425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>