More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24310 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_24310  inositol monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase family protein  100 
 
 
275 aa  535  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1511  Inositol-phosphate phosphatase  60.36 
 
 
266 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1313  inositol-1(or 4)-monophosphatase  50.18 
 
 
268 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.528727  normal  0.631294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1880  inositol monophosphatase  49.82 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1441  inositol-phosphate phosphatase  51.33 
 
 
270 aa  215  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6775  inositol-1(or 4)-monophosphatase  52.3 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2247  inositol monophosphatase  53.82 
 
 
304 aa  210  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1943  inositol-1(or 4)-monophosphatase  51.48 
 
 
266 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2463  inositol-phosphate phosphatase  49.82 
 
 
302 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2300  inositol monophosphatase  53.28 
 
 
284 aa  202  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1866  inositol monophosphatase  55.04 
 
 
272 aa  202  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.609869  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3937  inositol-phosphate phosphatase  48.75 
 
 
299 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517909  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16090  inositol monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase family protein  49.79 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155381  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1934  Inositol-phosphate phosphatase  52.34 
 
 
277 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4971  inositol monophosphatase  46.19 
 
 
268 aa  196  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1692  inositol monophosphatase  48.94 
 
 
269 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1625  Inositol-phosphate phosphatase  50.49 
 
 
274 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1476  inositol-phosphate phosphatase  52.84 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1700  inositol monophosphatase  56.31 
 
 
288 aa  188  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133893  normal  0.297038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2187  inositol-1(or 4)-monophosphatase  55.7 
 
 
286 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583892  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2233  inositol-phosphate phosphatase  55.7 
 
 
286 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.110995  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2912  inositol-phosphate phosphatase  45.98 
 
 
292 aa  185  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0545674  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1412  Inositol-phosphate phosphatase  48.31 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.881002 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2176  inositol-phosphate phosphatase  55.27 
 
 
286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.206731  decreased coverage  0.000814056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5201  inositol-phosphate phosphatase  46.5 
 
 
304 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1405  inositol-phosphate phosphatase  49.17 
 
 
282 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15810  inositol monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase family protein  44.37 
 
 
347 aa  181  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.125857  normal  0.0787941 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12716  extragenic suppressor protein suhB  52.34 
 
 
290 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0128  inositol monophosphatase  41.57 
 
 
258 aa  175  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3679  inositol-phosphate phosphatase  47.76 
 
 
240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4057  inositol monophosphatase  46.95 
 
 
268 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0345704  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  38.95 
 
 
267 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  38.4 
 
 
268 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1553  Inositol-phosphate phosphatase  55.39 
 
 
293 aa  169  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  38.11 
 
 
267 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  38.11 
 
 
267 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  38.11 
 
 
267 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  39.33 
 
 
267 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  39.25 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  38.87 
 
 
267 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  38.87 
 
 
267 aa  166  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  38.87 
 
 
267 aa  166  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  38.87 
 
 
267 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  38.87 
 
 
267 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  38.87 
 
 
267 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  38.87 
 
 
267 aa  166  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  37.74 
 
 
267 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  38.87 
 
 
267 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  38.87 
 
 
267 aa  166  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  37.74 
 
 
267 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2887  inositol monophosphatase  45.52 
 
 
270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.778817  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0644  Inositol-phosphate phosphatase  43.46 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1925  Inositol-phosphate phosphatase  45.04 
 
 
302 aa  163  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0922188  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  41.03 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3630  inositol monophosphatase  36.33 
 
 
267 aa  162  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0471893  normal  0.858784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  41.09 
 
 
266 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2754  inositol monophosphatase  37.78 
 
 
267 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00416326  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1273  inositol monophosphatase  38.31 
 
 
267 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000425107  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  37.75 
 
 
267 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  38.89 
 
 
263 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1165  inositol monophosphatase  38.31 
 
 
267 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000142854  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0438  inositol monophosphatase  38.31 
 
 
267 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450003  hitchhiker  0.0000301386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  38.74 
 
 
353 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  37.17 
 
 
330 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0963  Inositol-phosphate phosphatase  40.55 
 
 
322 aa  158  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.220962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1045  inositol-phosphate phosphatase  39.64 
 
 
347 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0806171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  38.39 
 
 
283 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1343  Inositol-phosphate phosphatase  46.01 
 
 
269 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000231696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2309  inositol-phosphate phosphatase  40.09 
 
 
304 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.315096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2463  inositol-phosphate phosphatase  45.83 
 
 
248 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2424  inositol-1(or 4)-monophosphatase  44.93 
 
 
248 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2469  inositol-phosphate phosphatase  44.93 
 
 
248 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  39.38 
 
 
262 aa  156  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3293  inositol-1(or 4)-monophosphatase  38.3 
 
 
328 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  35.63 
 
 
262 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1299  inositol-phosphate phosphatase  44.86 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140966  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  42.56 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2070  inositol monophosphatase  40.09 
 
 
313 aa  155  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  39.92 
 
 
272 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1824  inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.07 
 
 
283 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0421706  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  38.2 
 
 
271 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  39.92 
 
 
271 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  39.81 
 
 
267 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  39.92 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  39.92 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  39.92 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  0.00000000805299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  37.83 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4248  inositol-phosphate phosphatase  40.44 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0646891  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  39.5 
 
 
271 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  37.84 
 
 
431 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  39.92 
 
 
272 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  38.18 
 
 
288 aa  152  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  38.68 
 
 
267 aa  151  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05950  inositol monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase family protein  42.37 
 
 
305 aa  151  8.999999999999999e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.740752  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0004  inositol-phosphate phosphatase  41.95 
 
 
260 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01052  hypothetical protein  37.61 
 
 
267 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1534  inositol monophosphatase  42.49 
 
 
258 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0685889  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1028  inositol monophosphatase  34.5 
 
 
269 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00157763  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  37.5 
 
 
267 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1380  inositol-phosphate phosphatase  36.89 
 
 
330 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135454  hitchhiker  0.00587687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>