29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1430 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1430  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  248  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731285  hitchhiker  0.000462383 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  54.96 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  59.84 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1500  protein of unknown function DUF1236  49.25 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447894  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3677  hypothetical protein  65.75 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566857  hitchhiker  0.00495452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  63.04 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1396  protein of unknown function DUF1236  59.7 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.955591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4727  protein of unknown function DUF1236  56.72 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6932  protein of unknown function DUF1236  63.01 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0356  hypothetical protein  51.25 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0791  protein of unknown function DUF1236  59.84 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  53.01 
 
 		 221 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  51.81 
 
 		 221 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3557  hypothetical protein  50.82 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  42.7 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  51.47 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  52.94 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  43.38 
 
 		 220 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  34.65 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  46.9 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  37.74 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4035  hypothetical protein  43.94 
 
 		 170 aa  52.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662929  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4377  hypothetical protein  54.41 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  37.74 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  36.36 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  35.16 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  40.54 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  39.44 
 
 		 210 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>