More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0131 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



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Replicon accession

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0131  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
323 aa  657    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3691  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.57 
 
 
323 aa  630  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0803  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.57 
 
 
310 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.43209  normal  0.389634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2894  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.57 
 
 
310 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0375  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.57 
 
 
310 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1601  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.57 
 
 
310 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806368  normal  0.405689 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.57 
 
 
310 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.202718 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.21 
 
 
310 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3929  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.21 
 
 
310 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.613698  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3720  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.21 
 
 
309 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0045  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.94 
 
 
318 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0046  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.94 
 
 
318 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0094  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.94 
 
 
318 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.05206  hitchhiker  0.00363531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0132  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.94 
 
 
318 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0760311  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0488  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.94 
 
 
318 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0670  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.94 
 
 
318 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.375238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0723  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.94 
 
 
318 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120706  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0958  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.94 
 
 
318 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1143  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.94 
 
 
318 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1718  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.94 
 
 
318 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00396754  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2073  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.94 
 
 
318 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000159022  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2810  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.94 
 
 
318 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2975  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.94 
 
 
318 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3429  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  36.94 
 
 
318 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0519  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.72 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.72 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.72 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.72 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.909049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.72 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206363  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4601  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.72 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1149  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.13 
 
 
320 aa  162  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.852696  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1423  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.13 
 
 
320 aa  162  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0743274  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1739  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.13 
 
 
320 aa  162  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106448  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2894  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.13 
 
 
320 aa  162  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.940801  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2923  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.13 
 
 
320 aa  162  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.13 
 
 
320 aa  162  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.311525  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2517  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.43 
 
 
322 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0043  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.29 
 
 
321 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.29 
 
 
321 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.945374 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.29 
 
 
321 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0645698  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.29 
 
 
321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131589  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3440  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.88 
 
 
321 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.830328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3523  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.88 
 
 
321 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2238  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.88 
 
 
321 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4107  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.88 
 
 
321 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190664  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5809  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.88 
 
 
321 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  hitchhiker  0.000316639 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3420  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.88 
 
 
322 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.415822  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1817  transposase IS116/IS110/IS902  39.93 
 
 
321 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2208  transposase IS116/IS110/IS902  39.93 
 
 
321 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.93 
 
 
321 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.93 
 
 
321 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.76 
 
 
314 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1602  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.76 
 
 
314 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.76 
 
 
314 aa  149  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.76 
 
 
314 aa  149  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.934881 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1134  transposase IS116/IS110/IS902  33.21 
 
 
323 aa  149  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2664  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 
315 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219726  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0133  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 
315 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2708  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 
315 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2112  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.6 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.838809 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2742  ISCps7, transposase  32.83 
 
 
317 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102652  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3686  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.17 
 
 
309 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1548  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.17 
 
 
309 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.18 
 
 
316 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.8 
 
 
309 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4794  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.69 
 
 
315 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1179  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.69 
 
 
315 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5832  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.69 
 
 
315 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236486  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7866  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.69 
 
 
315 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8696  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.69 
 
 
315 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.8 
 
 
309 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0668  transposase IS110 family protein  40.38 
 
 
315 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.732525  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0821  transposase IS110 family protein  40.38 
 
 
315 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450951  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2316  transposase IS110 family protein  40.38 
 
 
315 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367866  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0654  transposase IS116/IS110/IS902  37.23 
 
 
328 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3340  transposase IS116/IS110/IS902  37.23 
 
 
328 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.91 
 
 
312 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573271  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.96 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2164  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.96 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0243723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0856  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1084  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.96 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0840793  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2924  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.91 
 
 
312 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.690618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2339  transposase IS110 family protein  40 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.354991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2936  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.96 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.91 
 
 
312 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.778833  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0388  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.21 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2289  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.21 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.795414  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3496  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.21 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.118492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1046  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  35.79 
 
 
316 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1261  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  35.79 
 
 
316 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.812718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1426  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  35.79 
 
 
316 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0372411  normal  0.895779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2597  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  35.79 
 
 
316 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3883  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  35.79 
 
 
316 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4991  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  35.79 
 
 
316 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0840  transposase IS116/IS110/IS902  32.46 
 
 
318 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0862  transposase IS116/IS110/IS902  32.46 
 
 
318 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.595658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1845  transposase IS116/IS110/IS902  32.46 
 
 
318 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1950  transposase IS116/IS110/IS902  32.46 
 
 
318 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0873071  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2653  transposase IS116/IS110/IS902  32.46 
 
 
318 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356975  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_3756  transposase IS116/IS110/IS902  32.46 
 
 
318 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.723193  n/a   
 
 
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