More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3720 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_3720  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
309 aa  622  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1601  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.68 
 
 
310 aa  617  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806368  normal  0.405689 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2894  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.68 
 
 
310 aa  617  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0375  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.68 
 
 
310 aa  617  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0803  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.68 
 
 
310 aa  617  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.43209  normal  0.389634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.68 
 
 
310 aa  617  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.202718 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3929  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.35 
 
 
310 aa  614  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.613698  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.35 
 
 
310 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3691  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.65 
 
 
323 aa  567  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0131  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.21 
 
 
323 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0045  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  37.5 
 
 
318 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0046  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  37.5 
 
 
318 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0094  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  37.5 
 
 
318 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.05206  hitchhiker  0.00363531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0132  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  37.5 
 
 
318 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0760311  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0488  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  37.5 
 
 
318 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0670  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  37.5 
 
 
318 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.375238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0723  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  37.5 
 
 
318 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120706  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0958  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  37.5 
 
 
318 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1143  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  37.5 
 
 
318 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1718  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  37.5 
 
 
318 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00396754  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2073  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  37.5 
 
 
318 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000159022  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2810  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  37.5 
 
 
318 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2975  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  37.5 
 
 
318 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3429  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  37.5 
 
 
318 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0519  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.78 
 
 
320 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.78 
 
 
320 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.78 
 
 
320 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.78 
 
 
320 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.909049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.78 
 
 
320 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206363  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4601  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.78 
 
 
320 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1149  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.07 
 
 
320 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.852696  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1423  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.07 
 
 
320 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0743274  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1739  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.07 
 
 
320 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106448  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2894  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.07 
 
 
320 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.940801  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2923  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.07 
 
 
320 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.07 
 
 
320 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.311525  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5809  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.97 
 
 
321 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  hitchhiker  0.000316639 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2238  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.97 
 
 
321 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3440  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.97 
 
 
321 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.830328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3523  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.97 
 
 
321 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4107  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.97 
 
 
321 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190664  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.94 
 
 
321 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0645698  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.94 
 
 
321 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.945374 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0043  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.94 
 
 
321 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.94 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131589  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2517  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.18 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1817  transposase IS116/IS110/IS902  39.61 
 
 
321 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2208  transposase IS116/IS110/IS902  39.61 
 
 
321 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.61 
 
 
321 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.61 
 
 
321 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3686  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.14 
 
 
309 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1548  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.14 
 
 
309 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1602  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.21 
 
 
314 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7866  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.18 
 
 
315 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1179  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.18 
 
 
315 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8696  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.18 
 
 
315 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5832  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.18 
 
 
315 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4794  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.18 
 
 
315 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.21 
 
 
314 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.21 
 
 
314 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.934881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.21 
 
 
314 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2664  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.8 
 
 
315 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219726  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0133  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.8 
 
 
315 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2708  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.8 
 
 
315 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3420  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.86 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.415822  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1134  transposase IS116/IS110/IS902  33.44 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.82 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.82 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.87 
 
 
316 aa  172  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2742  ISCps7, transposase  33.67 
 
 
317 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102652  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0654  transposase IS116/IS110/IS902  38.49 
 
 
328 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3340  transposase IS116/IS110/IS902  38.49 
 
 
328 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2112  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 
325 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.838809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0821  transposase IS110 family protein  40.4 
 
 
315 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450951  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0668  transposase IS110 family protein  40.4 
 
 
315 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.732525  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2316  transposase IS110 family protein  40.4 
 
 
315 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367866  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.58 
 
 
312 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573271  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1084  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.58 
 
 
312 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0840793  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2924  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.58 
 
 
312 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.690618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2936  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.58 
 
 
312 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.58 
 
 
312 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.778833  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2164  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.58 
 
 
312 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0243723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.58 
 
 
312 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2339  transposase IS110 family protein  40.07 
 
 
315 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.354991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0840  transposase IS116/IS110/IS902  33.33 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0862  transposase IS116/IS110/IS902  33.33 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.595658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1845  transposase IS116/IS110/IS902  33.33 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1950  transposase IS116/IS110/IS902  33.33 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0873071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2653  transposase IS116/IS110/IS902  33.33 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3756  transposase IS116/IS110/IS902  33.33 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.723193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0856  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.79 
 
 
318 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.14 
 
 
316 aa  165  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0987071  normal  0.815394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0388  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.33 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3496  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.33 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.118492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.41 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2289  transposase IS111A/IS1328/IS1533  33.33 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.795414  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4670  transposase IS110 family protein  39.4 
 
 
315 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0284  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.1 
 
 
316 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3800  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.1 
 
 
316 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.834348  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4477  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.1 
 
 
316 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>