19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1676 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1676  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  946    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.729068 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0034  hypothetical protein  66.59 
 
 
469 aa  632  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.907234 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4361  hypothetical protein  63.15 
 
 
473 aa  596  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1067  hypothetical protein  61.54 
 
 
479 aa  588  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0966  hypothetical protein  61.9 
 
 
457 aa  570  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.173877  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06331  hypothetical protein  59.52 
 
 
430 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.13594  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11011  hypothetical protein  54.88 
 
 
430 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0193058 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0409  hypothetical protein  54.66 
 
 
430 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.809492  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1799  hypothetical protein  50.74 
 
 
451 aa  449  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1045  hypothetical protein  49.23 
 
 
404 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07871  hypothetical protein  50.22 
 
 
439 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0459178  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08551  hypothetical protein  50.33 
 
 
438 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.219552  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07871  hypothetical protein  50.22 
 
 
439 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0737  hypothetical protein  49.57 
 
 
439 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00875447  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0756  hypothetical protein  47.02 
 
 
450 aa  400  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1000  hypothetical protein  47.11 
 
 
423 aa  394  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0413832  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0376  hypothetical protein  33.71 
 
 
505 aa  85.9  0.000000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0075  hypothetical protein  24.15 
 
 
424 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1240  hypothetical protein  29.9 
 
 
373 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.459037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>