29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0436 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0436  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.889027  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03065  hypothetical protein  77.78 
 
 
94 aa  135  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0215  hypothetical protein  51.52 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1122  hypothetical protein  48.48 
 
 
85 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1942  hypothetical protein  46.97 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0155  hypothetical protein  48.61 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123262  hitchhiker  0.0000255316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0790  hypothetical protein  47.22 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3746  hypothetical protein  42.03 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277012  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6828  hypothetical protein  45.95 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3623  hypothetical protein  52.86 
 
 
183 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3943  hypothetical protein  42.27 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0121243  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8119  hypothetical protein  41.18 
 
 
98 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0919  hypothetical protein  46.67 
 
 
91 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0454147  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0784  hypothetical protein  45.83 
 
 
93 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4277  hypothetical protein  43.42 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07890  hypothetical protein  36.05 
 
 
182 aa  51.6  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1249  hypothetical protein  42.86 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00737651  normal  0.251434 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1722  hypothetical protein  38.67 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0713  hypothetical protein  38.37 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.00000285629 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2656  hypothetical protein  42.25 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.482309 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  38.82 
 
 
310 aa  47.4  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  36.05 
 
 
289 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2354  hypothetical protein  36 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.907944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  40.28 
 
 
300 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21710  hypothetical protein  35.16 
 
 
195 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.177303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1381  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.122894 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  37.21 
 
 
289 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3956  hypothetical protein  42.25 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113603  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2328  hypothetical protein  34.57 
 
 
126 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00898416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>