13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2354 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2354  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  240  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.907944 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1030  hypothetical protein  56.86 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0212795 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1722  hypothetical protein  60.23 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0155  hypothetical protein  53.92 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123262  hitchhiker  0.0000255316 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2656  hypothetical protein  54.67 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.482309 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4277  hypothetical protein  46.15 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2328  hypothetical protein  51.22 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00898416  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6828  hypothetical protein  43.68 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1122  hypothetical protein  43.06 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0215  hypothetical protein  36.99 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03065  hypothetical protein  39.47 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0436  hypothetical protein  36 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.889027  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1942  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>