17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_R0060 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_R0060  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.203868  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0021  tRNA-Met  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00425805  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt20  tRNA-Met  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07711  tRNA-Met  88 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0018  tRNA-Met  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0015  tRNA-Met  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000155913  normal  0.449065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0009  tRNA-Met  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249848  normal  0.901496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0042  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00111432  normal  0.385328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0007  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00808178  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0217  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000283281  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0052  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0036  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.432918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0007  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0924996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0054  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0041  tRNA-Met  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0063  tRNA-Met  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0045  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0449962  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>