14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6651 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013731  Slin_6651  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.142646 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6897  hypothetical protein  86.17 
 
 
253 aa  431  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2338  hypothetical protein  43.93 
 
 
253 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00341  hypothetical protein  36.05 
 
 
252 aa  170  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0092  hypothetical protein  39.92 
 
 
235 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.237058 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0202  hypothetical protein  41.8 
 
 
247 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1086  hypothetical protein  35.81 
 
 
231 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0194  hypothetical protein  39.04 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2467  hypothetical protein  38.59 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2335  hypothetical protein  35.97 
 
 
242 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1145  hypothetical protein  33.71 
 
 
192 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0300  hypothetical protein  24.5 
 
 
298 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0452  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.2 
 
 
304 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.420259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1137  hypothetical protein  31.65 
 
 
192 aa  42.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>