More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5148 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  100 
 
 		 79 aa  154  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  83.12 
 
 		 78 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  81.82 
 
 		 78 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  80.52 
 
 		 78 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  75.32 
 
 		 78 aa  122  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  78.38 
 
 		 78 aa  118  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  75.64 
 
 		 82 aa  117  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  76 
 
 		 78 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  74.67 
 
 		 77 aa  114  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1765  acyl carrier protein  67.53 
 
 		 78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  69.74 
 
 		 79 aa  105  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  67.95 
 
 		 78 aa  104  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  67.95 
 
 		 78 aa  104  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  65.79 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 78 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 78 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 78 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 78 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  65.79 
 
 		 79 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 78 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 78 aa  100  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 77 aa  100  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  65.79 
 
 		 77 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 77 aa  99.4  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 78 aa  99.4  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 79 aa  98.6  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  60.76 
 
 		 81 aa  98.6  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 77 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 79 aa  98.6  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  64 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 79 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 79 aa  98.2  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 82 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 82 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 79 aa  97.1  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 78 aa  97.1  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 77 aa  97.1  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 78 aa  95.9  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  63.01 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  63.01 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 76 aa  95.5  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  63.01 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1208  hypothetical protein  61.54 
 
 		 80 aa  95.9  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000845225 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0639  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 77 aa  94.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  58.23 
 
 		 79 aa  94.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 84 aa  94.4  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  58.44 
 
 		 79 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3949  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>