29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1504 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1504  flavoprotein-like protein  100 
 
 
199 aa  415  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0437844  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  25.75 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  23.63 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  27.03 
 
 
184 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  23.18 
 
 
188 aa  45.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  21.47 
 
 
216 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  20.65 
 
 
197 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  25.66 
 
 
203 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  25.79 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2299  NADPH-dependent FMN reductase  33.72 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197396  hitchhiker  0.00422295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  27.94 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  23.68 
 
 
182 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  25.55 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  26.8 
 
 
182 aa  42.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  27.07 
 
 
204 aa  42  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.81 
 
 
185 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  29.79 
 
 
184 aa  42  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  28.81 
 
 
185 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.81 
 
 
185 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  24.87 
 
 
185 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  28.93 
 
 
190 aa  41.6  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  24.51 
 
 
183 aa  41.6  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.81 
 
 
185 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.81 
 
 
181 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.81 
 
 
185 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.81 
 
 
185 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.81 
 
 
185 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>