14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1372 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1372  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
252 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0780489  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1383  Alkaline phosphatase  39.65 
 
 
608 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4822  alkaline phosphatase  37.61 
 
 
261 aa  161  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3249  alkaline phosphatase  38.91 
 
 
607 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3513  hypothetical protein  32.48 
 
 
646 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.5 
 
 
672 aa  126  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2129  secreted protein  33.74 
 
 
288 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3533  hypothetical protein  31.15 
 
 
323 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.822199  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22760  hypothetical protein  31.22 
 
 
296 aa  118  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.488821  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0006  Alkaline phosphatase  30.94 
 
 
610 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50499  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4257  secreted protein  28.99 
 
 
311 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.256358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6675  hypothetical protein  29.5 
 
 
277 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02145  hypothetical protein  25.26 
 
 
493 aa  70.1  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.935466 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08808  hypothetical protein  22.48 
 
 
335 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>