22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0367 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0367  protein of unknown function DUF450  100 
 
 		 147 aa  306  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2421  hypothetical protein  51.37 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1250  protein of unknown function DUF450  49.65 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344127  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0461  protein of unknown function DUF450  47.95 
 
 		 151 aa  153  8e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2919  hypothetical protein  45.21 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1440  hypothetical protein  44.52 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0314502 
 
 
-
 
NC_002950  PG0947  hypothetical protein  43.84 
 
 		 157 aa  136  7.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.138847 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11283  hypothetical protein  41.1 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1526  hypothetical protein  41.38 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1807  protein of unknown function DUF450  42.86 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.648369  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1997  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  116  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0838  hypothetical protein  36.04 
 
 		 418 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174927  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0689  DNA methylase-type I restriction-modification system  33.33 
 
 		 687 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  30.89 
 
 		 657 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3600  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 738 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3247  N-6 DNA methylase  31.34 
 
 		 748 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0754  hypothetical protein  25.33 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.774812  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0544  type I restriction-modification system, M subunit, putative  31.65 
 
 		 648 aa  48.9  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1224  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 		 796 aa  46.2  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.708606 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  32.2 
 
 		 819 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.4 
 
 		 654 aa  44.3  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0921  N-6 DNA methylase  27.55 
 
 		 676 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>