22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24760  conserved repeat protein  100 
 
 		 1516 aa  2943    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.216781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0149  von Willebrand factor type A  35.8 
 
 		 2262 aa  201  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.563558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5685  conserved repeat domain protein  46.4 
 
 		 471 aa  178  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0455  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  42.54 
 
 		 171 aa  79.3  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  32.4 
 
 		 2588 aa  77.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5567  von Willebrand factor type A  27.21 
 
 		 684 aa  74.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0045  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.33 
 
 		 1468 aa  73.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.292772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  26.4 
 
 		 2487 aa  74.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  33.86 
 
 		 1946 aa  72.8  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3021  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  48.1 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4228  conserved repeat domain protein  31.2 
 
 		 2395 aa  60.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.687969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  24.02 
 
 		 3191 aa  59.3  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0147  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.39 
 
 		 2724 aa  59.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0148  conserved repeat domain protein  31.53 
 
 		 2553 aa  55.5  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  31.5 
 
 		 3911 aa  53.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  27.15 
 
 		 693 aa  51.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0770  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.14 
 
 		 231 aa  50.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  25 
 
 		 484 aa  49.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  29.27 
 
 		 489 aa  48.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  36.79 
 
 		 807 aa  48.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3020  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1482 aa  48.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  38.55 
 
 		 924 aa  47.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>