More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24120 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_24120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
332 aa  683    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0208  Luciferase-like monooxygenase  89.73 
 
 
333 aa  619  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1412  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  86.97 
 
 
333 aa  606  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349284  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2587  Luciferase-like monooxygenase  85.84 
 
 
332 aa  599  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1130  Luciferase-like monooxygenase  83.43 
 
 
332 aa  590  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  71.95 
 
 
329 aa  505  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  68.69 
 
 
329 aa  488  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  59.94 
 
 
334 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  57.49 
 
 
335 aa  413  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3981  luciferase family protein  61.4 
 
 
329 aa  408  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0510411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1140  luciferase family protein  61.47 
 
 
332 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  58.72 
 
 
332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4037  putative dehydrogenase protein  45.59 
 
 
323 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122035  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7870  putative dehydrogenase protein  41.95 
 
 
318 aa  238  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4597  putative dehydrogenase protein  42.38 
 
 
329 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4685  putative dehydrogenase protein  42.38 
 
 
329 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348286  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4980  putative dehydrogenase protein  42.38 
 
 
329 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0670  Luciferase-like monooxygenase  40.43 
 
 
318 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3722  putative dehydrogenase protein  42.99 
 
 
325 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0414555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3081  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  41.03 
 
 
349 aa  229  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.903709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4087  putative dehydrogenase protein  40.12 
 
 
328 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  37.24 
 
 
342 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5283  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.61 
 
 
326 aa  222  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1142  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.74 
 
 
318 aa  222  7e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.88 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5026  Luciferase-like monooxygenase  39.94 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.798611  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3709  Luciferase-like monooxygenase  39.51 
 
 
325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2231  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.88 
 
 
321 aa  212  5.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.95 
 
 
318 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8019  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  35.54 
 
 
325 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  34.73 
 
 
336 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0743  luciferase family protein  35.54 
 
 
320 aa  208  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  34.43 
 
 
336 aa  205  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5578  putative dehydrogenase protein  36.34 
 
 
321 aa  202  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  34.63 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  34.25 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4853  Luciferase-like monooxygenase  37.65 
 
 
321 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00131867  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  33.63 
 
 
336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7147  Luciferase-like monooxygenase  39.01 
 
 
343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348721  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  33.53 
 
 
336 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  33.53 
 
 
336 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  33.53 
 
 
336 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.73 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6346  luciferase family protein  39.32 
 
 
343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310691  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  35.74 
 
 
336 aa  196  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5600  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  34.24 
 
 
321 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1273  putative dehydrogenase protein  37.61 
 
 
320 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3224  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  38.78 
 
 
343 aa  192  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000991835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.8 
 
 
331 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4387  Luciferase-like, subgroup  34.22 
 
 
339 aa  192  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.128943  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1669  hypothetical protein  34.35 
 
 
321 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3201  luciferase-like protein  34.56 
 
 
320 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1435  putative dehydrogenase protein  38.53 
 
 
320 aa  188  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.59 
 
 
321 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1275  putative dehydrogenase protein  38.23 
 
 
320 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  32.32 
 
 
325 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  35.74 
 
 
337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  32.93 
 
 
324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4584  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.25 
 
 
321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  35.24 
 
 
321 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3680  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.42 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  35.74 
 
 
342 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2747  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.17 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4126  luciferase family protein  34.85 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.04 
 
 
331 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3627  dehydrogenase  35.05 
 
 
319 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  32.63 
 
 
336 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  30.84 
 
 
322 aa  176  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4855  luciferase-like protein  35.22 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4944  luciferase family protein  35.22 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5223  luciferase family protein  35.22 
 
 
330 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.018076 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3215  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  32.73 
 
 
334 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.912024  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5098  Luciferase-like monooxygenase  32.83 
 
 
379 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0922  luciferase family protein  31.95 
 
 
338 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  32.53 
 
 
322 aa  165  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  31.94 
 
 
330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5448  luciferase family protein  34.07 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  32.33 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18990  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.64 
 
 
325 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.873493  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1341  luciferase family protein  33.02 
 
 
328 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.973005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2479  Luciferase-like monooxygenase  33.02 
 
 
331 aa  153  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000324346  hitchhiker  0.00415555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  32.72 
 
 
360 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6790  luciferase family protein  33.23 
 
 
322 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1544  luciferase family protein  30.72 
 
 
320 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708084  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1586  luciferase family protein  30.12 
 
 
503 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.648959  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0280  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.32 
 
 
260 aa  143  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2078  hypothetical protein  44.79 
 
 
287 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961644  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  25.96 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0202  Luciferase-like monooxygenase  23.84 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  29.95 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  27.63 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  26.33 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.63 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  25.91 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  28.32 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.97 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.88 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  35.43 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  35.43 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.39 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>