15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13610 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13610  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  804    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.470397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4070  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.91 
 
 		 358 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0582  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.22 
 
 		 405 aa  87  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25300  membrane-fusion protein  42.19 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0084  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.19 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1030  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.08 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0306  hypothetical protein  36.81 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.1 
 
 		 605 aa  74.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5941  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.25 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4786  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.38 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0569189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0082  hypothetical protein  39.13 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.619134 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10570  hypothetical protein  34.01 
 
 		 305 aa  45.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0027  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.16 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.29 
 
 		 580 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>