66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08120 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08120  predicted membrane protein  100 
 
 		 276 aa  540  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21552  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0922  protein of unknown function DUF1112  64.86 
 
 		 272 aa  337  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0943972  normal  0.459659 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1900  protein of unknown function DUF1112  63.08 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.731906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1053  protein of unknown function DUF1112  53.82 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.933646  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2672  protein of unknown function DUF1112  59.23 
 
 		 299 aa  248  6e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05030  predicted membrane protein  49.32 
 
 		 292 aa  245  6e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0406876  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1232  protein of unknown function DUF1112  50.34 
 
 		 299 aa  235  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1159  hypothetical protein  50.56 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1080  protein of unknown function DUF1112  44.52 
 
 		 283 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08040  predicted membrane protein  41.5 
 
 		 307 aa  185  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170017  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4008  protein of unknown function DUF1112  47.2 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0459131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0697  protein of unknown function DUF1112  40.36 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4424  protein of unknown function DUF1112  42.21 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.938126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0849  hypothetical protein  40.36 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.148418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0906  hypothetical protein  40.36 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8572  hypothetical protein  40.32 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1043  protein of unknown function DUF1112  40.54 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.968328  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1614  protein of unknown function DUF1112  40.61 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11090  transmembrane protein  37.99 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00918655  normal  0.405264 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07090  predicted membrane protein  38.55 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31920  predicted membrane protein  40.51 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0724336  normal  0.289681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0928  protein of unknown function DUF1112  38.46 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282328  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3154  protein of unknown function DUF1112  42.21 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.254668  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3124  hypothetical protein  34.84 
 
 		 281 aa  142  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000741155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0937  hypothetical protein  33.22 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4385  hypothetical protein  37.63 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4154  hypothetical protein  37.63 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4229  hypothetical protein  37.63 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132482  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2299  hypothetical protein  36.97 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2205  hypothetical protein  36.97 
 
 		 253 aa  136  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3916  hypothetical protein  37.02 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1232  hypothetical protein  37.99 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1813  hypothetical protein  37.34 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.560392  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1614  hypothetical protein  41.99 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0744977  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  34.72 
 
 		 323 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4679  hypothetical protein  34.56 
 
 		 283 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0753806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02484  hypothetical protein  37.5 
 
 		 253 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1103  hypothetical protein  41.05 
 
 		 272 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312011  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0088  hypothetical protein  40.33 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00170259  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2038  hypothetical protein  39.74 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.20707  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1153  protein of unknown function DUF1112  40.64 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.771607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1826  hypothetical protein  37.93 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194611  normal  0.0800768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0813  hypothetical protein  35.1 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734486  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0833  protein of unknown function DUF1112  42.54 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.195827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1059  protein of unknown function DUF1112  30.95 
 
 		 244 aa  119  7.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0079  protein of unknown function DUF1112  33.55 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.735437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0619  hypothetical protein  34.29 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.887697 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2001  hypothetical protein  32.13 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000219658  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2587  protein of unknown function DUF1112  38.89 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1644  hypothetical protein  31.47 
 
 		 240 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000319229  hitchhiker  0.000785706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2434  hypothetical protein  33.65 
 
 		 244 aa  96.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1614  hypothetical protein  34.45 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000915108  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1466  hypothetical protein  30.6 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205564  hitchhiker  0.0000276724 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3144  hypothetical protein  34.45 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000710256  normal  0.0132365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2174  hypothetical protein  34.45 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000207906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2226  hypothetical protein  34.6 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000010453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2309  hypothetical protein  34.6 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000311917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2011  hypothetical protein  34.6 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000505565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1983  hypothetical protein  34.6 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.45076e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1965  hypothetical protein  34.6 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000219502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2165  hypothetical protein  34.6 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000608319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2191  hypothetical protein  34.12 
 
 		 243 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1461  hypothetical protein  34.39 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0477327  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1262  hypothetical protein  34.39 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00222992  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1618  hypothetical protein  32.54 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.506655  hitchhiker  0.00000000806776 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0083  hypothetical protein  29.33 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>