66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1618 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1618  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  471  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.506655  hitchhiker  0.00000000806776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1644  hypothetical protein  71.37 
 
 
240 aa  347  1e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000319229  hitchhiker  0.000785706 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1466  hypothetical protein  70.95 
 
 
240 aa  344  6e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205564  hitchhiker  0.0000276724 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1059  protein of unknown function DUF1112  37.14 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1232  hypothetical protein  37.5 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2205  hypothetical protein  38.86 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2299  hypothetical protein  37.99 
 
 
253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1153  protein of unknown function DUF1112  36.73 
 
 
247 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.771607 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02484  hypothetical protein  40.09 
 
 
253 aa  121  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2587  protein of unknown function DUF1112  35.68 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0088  hypothetical protein  34.96 
 
 
247 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00170259  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1103  hypothetical protein  34.96 
 
 
272 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312011  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1813  hypothetical protein  33.74 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.560392  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0697  protein of unknown function DUF1112  32.03 
 
 
269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2001  hypothetical protein  32.52 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000219658  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4154  hypothetical protein  32.54 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4229  hypothetical protein  32.54 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132482  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4385  hypothetical protein  32.54 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143789  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2434  hypothetical protein  36.44 
 
 
244 aa  108  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0937  hypothetical protein  34.29 
 
 
294 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1614  hypothetical protein  32.93 
 
 
243 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0744977  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2309  hypothetical protein  34.96 
 
 
243 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000311917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2191  hypothetical protein  34.96 
 
 
243 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2226  hypothetical protein  34.96 
 
 
243 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000010453  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0833  protein of unknown function DUF1112  37.55 
 
 
252 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.195827  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2011  hypothetical protein  34.55 
 
 
243 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000505565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2174  hypothetical protein  34.55 
 
 
243 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000207906  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3144  hypothetical protein  34.55 
 
 
243 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000710256  normal  0.0132365 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1965  hypothetical protein  34.55 
 
 
243 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000219502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2165  hypothetical protein  34.55 
 
 
243 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000608319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1983  hypothetical protein  34.55 
 
 
243 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.45076e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1614  hypothetical protein  34.43 
 
 
243 aa  105  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000915108  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31920  predicted membrane protein  32.31 
 
 
282 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0724336  normal  0.289681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0906  hypothetical protein  39.08 
 
 
271 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1614  protein of unknown function DUF1112  33.19 
 
 
285 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0922  protein of unknown function DUF1112  34.09 
 
 
272 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0943972  normal  0.459659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0849  hypothetical protein  39.08 
 
 
271 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.148418 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11090  transmembrane protein  29.88 
 
 
278 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00918655  normal  0.405264 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3154  protein of unknown function DUF1112  34.03 
 
 
299 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.254668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4424  protein of unknown function DUF1112  30 
 
 
258 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.938126  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1053  protein of unknown function DUF1112  35.87 
 
 
298 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.933646  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07090  predicted membrane protein  32.59 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2038  hypothetical protein  33.48 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.20707  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4679  hypothetical protein  31.75 
 
 
283 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0753806  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8572  hypothetical protein  30.22 
 
 
261 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1080  protein of unknown function DUF1112  30.32 
 
 
283 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0619  hypothetical protein  30.6 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.887697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0928  protein of unknown function DUF1112  33.47 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282328  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05030  predicted membrane protein  34.52 
 
 
292 aa  89  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0406876  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08040  predicted membrane protein  33.53 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170017  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1159  hypothetical protein  35.29 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08120  predicted membrane protein  32.54 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21552  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3124  hypothetical protein  27.5 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000741155 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0083  hypothetical protein  29.81 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1043  protein of unknown function DUF1112  32.32 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.968328  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3916  hypothetical protein  30.49 
 
 
252 aa  79  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  29.71 
 
 
323 aa  78.6  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1232  protein of unknown function DUF1112  32.73 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0813  hypothetical protein  34.59 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734486  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2672  protein of unknown function DUF1112  33.92 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1461  hypothetical protein  33.53 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0477327  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1262  hypothetical protein  33.53 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00222992  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4008  protein of unknown function DUF1112  31.18 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0459131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0079  protein of unknown function DUF1112  31.2 
 
 
310 aa  72  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.735437  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1900  protein of unknown function DUF1112  32.91 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.731906  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1826  hypothetical protein  28.51 
 
 
265 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194611  normal  0.0800768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>