66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3916 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3916  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  488  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0813  hypothetical protein  67.66 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734486  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4424  protein of unknown function DUF1112  38.08 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.938126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1080  protein of unknown function DUF1112  34.78 
 
 		 283 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8572  hypothetical protein  35.8 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1043  protein of unknown function DUF1112  35.11 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.968328  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0922  protein of unknown function DUF1112  38.11 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0943972  normal  0.459659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0697  protein of unknown function DUF1112  37.08 
 
 		 269 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3154  protein of unknown function DUF1112  38.91 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.254668  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08120  predicted membrane protein  37.02 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21552  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0849  hypothetical protein  35.16 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.148418 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2299  hypothetical protein  35.02 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0906  hypothetical protein  34.07 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0928  protein of unknown function DUF1112  36.27 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282328  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1614  protein of unknown function DUF1112  37.6 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11090  transmembrane protein  35.64 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00918655  normal  0.405264 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2205  hypothetical protein  35.02 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31920  predicted membrane protein  35.23 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0724336  normal  0.289681 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1059  protein of unknown function DUF1112  32.76 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1153  protein of unknown function DUF1112  33.74 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.771607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0937  hypothetical protein  31.3 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02484  hypothetical protein  34.24 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4154  hypothetical protein  32.03 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4385  hypothetical protein  32.03 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4008  protein of unknown function DUF1112  32.38 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0459131 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4229  hypothetical protein  32.03 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132482  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1900  protein of unknown function DUF1112  31.58 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.731906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0088  hypothetical protein  30.04 
 
 		 247 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00170259  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1232  protein of unknown function DUF1112  33.33 
 
 		 299 aa  115  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3124  hypothetical protein  35.87 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000741155 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0619  hypothetical protein  30.83 
 
 		 241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.887697 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0833  protein of unknown function DUF1112  35.38 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.195827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1826  hypothetical protein  32.46 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194611  normal  0.0800768 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05030  predicted membrane protein  32.97 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0406876  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07090  predicted membrane protein  33.2 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1614  hypothetical protein  30.16 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0744977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1813  hypothetical protein  28.17 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.560392  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1103  hypothetical protein  28.85 
 
 		 272 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312011  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1159  hypothetical protein  29.44 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4679  hypothetical protein  32.62 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0753806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1053  protein of unknown function DUF1112  35.5 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.933646  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2038  hypothetical protein  31.91 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.20707  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1232  hypothetical protein  28.12 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1644  hypothetical protein  30.49 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000319229  hitchhiker  0.000785706 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2587  protein of unknown function DUF1112  29.8 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2434  hypothetical protein  31.4 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1466  hypothetical protein  29.15 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205564  hitchhiker  0.0000276724 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1461  hypothetical protein  29.3 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0477327  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1262  hypothetical protein  29.3 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00222992  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08040  predicted membrane protein  32.2 
 
 		 307 aa  88.6  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170017  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2672  protein of unknown function DUF1112  33.06 
 
 		 299 aa  88.6  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2001  hypothetical protein  27.27 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000219658  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  29.17 
 
 		 323 aa  86.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1618  hypothetical protein  30.49 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.506655  hitchhiker  0.00000000806776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0079  protein of unknown function DUF1112  30.52 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.735437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3144  hypothetical protein  30.04 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000710256  normal  0.0132365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2174  hypothetical protein  30.04 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000207906  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2309  hypothetical protein  29.64 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2165  hypothetical protein  29.64 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000608319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1965  hypothetical protein  29.64 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000219502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1983  hypothetical protein  29.64 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.45076e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2011  hypothetical protein  29.64 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000505565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2226  hypothetical protein  29.64 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000010453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2191  hypothetical protein  29.25 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1614  hypothetical protein  29.8 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000915108  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0083  hypothetical protein  28.48 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>