66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31920 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_31920  predicted membrane protein  100 
 
 
282 aa  550  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0724336  normal  0.289681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0697  protein of unknown function DUF1112  60.92 
 
 
269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4424  protein of unknown function DUF1112  50.88 
 
 
258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.938126  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0928  protein of unknown function DUF1112  52.94 
 
 
281 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282328  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11090  transmembrane protein  48.81 
 
 
278 aa  215  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00918655  normal  0.405264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4154  hypothetical protein  47.16 
 
 
282 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4385  hypothetical protein  47.16 
 
 
282 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143789  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4229  hypothetical protein  47.16 
 
 
282 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132482  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3154  protein of unknown function DUF1112  47.39 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.254668  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0849  hypothetical protein  42.14 
 
 
271 aa  199  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.148418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0906  hypothetical protein  41.28 
 
 
271 aa  193  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2038  hypothetical protein  46.39 
 
 
285 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.20707  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1614  protein of unknown function DUF1112  42.66 
 
 
285 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4679  hypothetical protein  44.33 
 
 
283 aa  175  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0753806  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0922  protein of unknown function DUF1112  41.3 
 
 
272 aa  172  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0943972  normal  0.459659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8572  hypothetical protein  42.86 
 
 
261 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1043  protein of unknown function DUF1112  40.49 
 
 
261 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.968328  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08120  predicted membrane protein  42.04 
 
 
276 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21552  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1232  protein of unknown function DUF1112  39.1 
 
 
299 aa  158  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05030  predicted membrane protein  42.68 
 
 
292 aa  158  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0406876  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1159  hypothetical protein  36.54 
 
 
308 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1080  protein of unknown function DUF1112  40.64 
 
 
283 aa  155  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3124  hypothetical protein  39.39 
 
 
281 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000741155 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2205  hypothetical protein  41.56 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2299  hypothetical protein  41.13 
 
 
253 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1053  protein of unknown function DUF1112  39.93 
 
 
298 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.933646  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1900  protein of unknown function DUF1112  41.84 
 
 
276 aa  149  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.731906  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  37.19 
 
 
323 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1644  hypothetical protein  39.15 
 
 
240 aa  143  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000319229  hitchhiker  0.000785706 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1614  hypothetical protein  37.3 
 
 
243 aa  143  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0744977  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1466  hypothetical protein  39.15 
 
 
240 aa  143  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205564  hitchhiker  0.0000276724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1826  hypothetical protein  36.88 
 
 
265 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194611  normal  0.0800768 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0088  hypothetical protein  39.74 
 
 
247 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00170259  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3916  hypothetical protein  36.88 
 
 
252 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1813  hypothetical protein  38.67 
 
 
243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.560392  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2587  protein of unknown function DUF1112  39.08 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02484  hypothetical protein  39.83 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0079  protein of unknown function DUF1112  39.54 
 
 
310 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.735437  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0833  protein of unknown function DUF1112  40.77 
 
 
252 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.195827  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0937  hypothetical protein  30.74 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1103  hypothetical protein  38.6 
 
 
272 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312011  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08040  predicted membrane protein  38.95 
 
 
307 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170017  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1232  hypothetical protein  34.92 
 
 
257 aa  125  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1059  protein of unknown function DUF1112  34.06 
 
 
244 aa  125  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2672  protein of unknown function DUF1112  36.51 
 
 
299 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0619  hypothetical protein  32.02 
 
 
241 aa  124  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.887697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1153  protein of unknown function DUF1112  36.26 
 
 
247 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.771607 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4008  protein of unknown function DUF1112  38.64 
 
 
249 aa  122  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0459131 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2001  hypothetical protein  34.19 
 
 
243 aa  118  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000219658  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07090  predicted membrane protein  33.81 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2434  hypothetical protein  34.68 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1618  hypothetical protein  31.58 
 
 
242 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.506655  hitchhiker  0.00000000806776 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2165  hypothetical protein  34.62 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000608319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1965  hypothetical protein  34.62 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000219502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1983  hypothetical protein  34.62 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.45076e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2011  hypothetical protein  34.62 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000505565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2174  hypothetical protein  34.62 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000207906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2226  hypothetical protein  34.62 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000010453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2309  hypothetical protein  34.62 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000311917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3144  hypothetical protein  34.62 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000710256  normal  0.0132365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2191  hypothetical protein  34.19 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0813  hypothetical protein  32.85 
 
 
265 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734486  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1614  hypothetical protein  34.19 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000915108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1461  hypothetical protein  39.22 
 
 
240 aa  95.9  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0477327  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1262  hypothetical protein  39.22 
 
 
240 aa  95.5  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00222992  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0083  hypothetical protein  32.19 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>