16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1599 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1532  hypothetical protein  97.33 
 
 
374 aa  722    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1599  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  743    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1593  hypothetical protein  93.85 
 
 
374 aa  699    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1856  hypothetical protein  54.28 
 
 
399 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1817  hypothetical protein  54.28 
 
 
399 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2469  hypothetical protein  53.74 
 
 
399 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.056918  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1809  hypothetical protein  54.01 
 
 
399 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1620  hypothetical protein  54.72 
 
 
387 aa  348  9e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1842  hypothetical protein  70.66 
 
 
242 aa  296  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1845  hypothetical protein  32.35 
 
 
384 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.940266  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1841  hypothetical protein  66.67 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2510  hypothetical protein  26.03 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1475  hypothetical protein  27 
 
 
348 aa  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1713  hypothetical protein  23.54 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  22.2 
 
 
1006 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2048  hypothetical protein  32.31 
 
 
362 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.802399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>