143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0986 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1115  aminoacyl-histidine dipeptidase  94.85 
 
 
486 aa  959    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3350  aminoacyl-histidine dipeptidase  93.2 
 
 
486 aa  941    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1011  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  81.89 
 
 
486 aa  838    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.855655  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0948  M20C family Xaa-His dipeptidase  99.79 
 
 
487 aa  1003    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0986  M20C family Xaa-His dipeptidase  100 
 
 
487 aa  1004    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0962  aminoacyl-histidine dipeptidase  81.44 
 
 
487 aa  832    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405496  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0950  M20C family Xaa-His dipeptidase  99.18 
 
 
487 aa  997    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.478343  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2519  Xaa-His dipeptidase  83.3 
 
 
486 aa  842    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22557  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0940  aminoacyl-histidine dipeptidase  92.8 
 
 
486 aa  941    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.282545  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2852  aminoacyl-histidine dipeptidase  82.51 
 
 
486 aa  837    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.017395  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0954  aminoacyl-histidine dipeptidase  92.99 
 
 
491 aa  940    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0173315  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3422  aminoacyl-histidine dipeptidase  93.2 
 
 
486 aa  941    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004273  aminoacyl-histidine dipeptidase (Peptidase D)  63.02 
 
 
490 aa  640    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01157  aminoacyl-histidine dipeptidase  63.02 
 
 
490 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3421  Xaa-His dipeptidase  80.86 
 
 
486 aa  825    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.11643  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3091  aminoacyl-histidine dipeptidase  83.74 
 
 
486 aa  844    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3547  aminoacyl-histidine dipeptidase  92.39 
 
 
486 aa  939    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3603  aminoacyl-histidine dipeptidase  81.07 
 
 
497 aa  823    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.905731  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0963  aminoacyl-histidine dipeptidase  61.44 
 
 
486 aa  625  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0346  aminoacyl-histidine dipeptidase  62.06 
 
 
485 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0296229  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0355  aminoacyl-histidine dipeptidase  62.06 
 
 
485 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0357  aminoacyl-histidine dipeptidase  62.06 
 
 
485 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000446766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0350  aminoacyl-histidine dipeptidase  62.06 
 
 
485 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3156  aminoacyl-histidine dipeptidase  60.62 
 
 
486 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3295  aminoacyl-histidine dipeptidase  60.62 
 
 
486 aa  624  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0365  aminoacyl-histidine dipeptidase  61.86 
 
 
485 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0973  aminoacyl-histidine dipeptidase  61.03 
 
 
484 aa  620  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.444707  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3307  aminoacyl-histidine dipeptidase  60.21 
 
 
486 aa  619  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00393893  hitchhiker  0.00000164378 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0763  aminoacyl-histidine dipeptidase  60.62 
 
 
485 aa  615  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62172  normal  0.0792119 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1869  aminoacyl-histidine dipeptidase  60.54 
 
 
534 aa  616  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.550605  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00232  aminoacyl-histidine dipeptidase (peptidase D)  60.82 
 
 
485 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00235  hypothetical protein  60.82 
 
 
485 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0264  aminoacyl-histidine dipeptidase  60.62 
 
 
485 aa  608  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0269  aminoacyl-histidine dipeptidase  60.62 
 
 
485 aa  608  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3344  aminoacyl-histidine dipeptidase  60.62 
 
 
485 aa  609  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0291  aminoacyl-histidine dipeptidase  60.82 
 
 
485 aa  610  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0453943 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0234  aminoacyl-histidine dipeptidase  60.82 
 
 
485 aa  610  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0282  aminoacyl-histidine dipeptidase  60.82 
 
 
485 aa  610  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.447065 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3370  aminoacyl-histidine dipeptidase  60.62 
 
 
485 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0180  aminoacyl-histidine dipeptidase  58.93 
 
 
487 aa  602  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0895  aminoacyl-histidine dipeptidase  58.97 
 
 
486 aa  599  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3290  aminoacyl-histidine dipeptidase  58.97 
 
 
486 aa  598  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3437  aminoacyl-histidine dipeptidase  59.18 
 
 
486 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0928  aminoacyl-histidine dipeptidase  58.56 
 
 
486 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0004  M20C family Xaa-His dipeptidase  51.43 
 
 
486 aa  505  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1680  Pep581 peptidase. metallo peptidase. MEROPS family M20C  46.89 
 
 
484 aa  495  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0945346  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1387  aminoacyl-histidine dipeptidase  48.95 
 
 
493 aa  491  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0727929  unclonable  0.0000123065 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1222  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.71 
 
 
486 aa  487  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.121021  hitchhiker  0.000871052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1584  aminoacyl-histidine dipeptidase  48.23 
 
 
488 aa  484  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1142  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.15 
 
 
500 aa  474  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0672748  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0525  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  46.14 
 
 
483 aa  458  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_002950  PG0137  aminoacyl-histidine dipeptidase  43.42 
 
 
484 aa  439  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.49846 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0894  aminoacyl-histidine dipeptidase  43.51 
 
 
485 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.011645  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12668  aminoacyl-histidine dipeptidase  44.1 
 
 
487 aa  439  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0537  aminoacyl-histidine dipeptidase  43.78 
 
 
486 aa  432  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2053  aminoacyl-histidine dipeptidase  42.74 
 
 
484 aa  425  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.754488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2400  aminoacyl-histidine dipeptidase  40.66 
 
 
486 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233033  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1035  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.96 
 
 
485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.180631  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2364  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.7 
 
 
484 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  0.043104 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2361  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.89 
 
 
490 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1744  aminoacyl-histidine dipeptidase  42.59 
 
 
482 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2957  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  43.84 
 
 
487 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.974491  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1720  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  43.07 
 
 
484 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1504  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  39.58 
 
 
486 aa  375  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2403  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.55 
 
 
483 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0857  aminoacyl-histidine dipeptidase  40.08 
 
 
484 aa  364  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2115  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.14 
 
 
483 aa  363  4e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3389  aminoacyl-histidine dipeptidase  40.08 
 
 
484 aa  362  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00176848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2527  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.88 
 
 
489 aa  358  8e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2587  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.88 
 
 
489 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00120702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1800  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.95 
 
 
489 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2240  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.08 
 
 
489 aa  356  5e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0840688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2319  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.88 
 
 
489 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2498  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.88 
 
 
489 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2514  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.88 
 
 
489 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.411549 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2284  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.88 
 
 
489 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00268357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2447  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.08 
 
 
489 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2301  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.5 
 
 
489 aa  351  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.280973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2888  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.88 
 
 
489 aa  350  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120289  normal  0.458811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3039  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.32 
 
 
506 aa  335  9e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000107892  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1877  aminoacyl-histidine dipeptidase  40.62 
 
 
484 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.326174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1798  aminoacyl-histidine dipeptidase  40.17 
 
 
484 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2512  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.99 
 
 
483 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2216  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.38 
 
 
483 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0150704  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2228  aminoacyl-histidine dipeptidase, putative  37.29 
 
 
481 aa  323  5e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2079  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  40.21 
 
 
484 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.165641  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2706  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.79 
 
 
479 aa  318  1e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.291599  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2963  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.79 
 
 
487 aa  311  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000053786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3149  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.07 
 
 
476 aa  309  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.35499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2796  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.62 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000441457  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0316  aminoacyl-histidine dipeptidase  34.38 
 
 
471 aa  299  6e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0516  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.78 
 
 
492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0622  aminoacyl-histidine dipeptidase  33.48 
 
 
476 aa  272  1e-71  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.155688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3432  aminoacyl-histidine dipeptidase  31.48 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00107226  hitchhiker  0.000115392 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1343  Xaa-His dipeptidase  31.5 
 
 
428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0809  aminoacyl-histidine dipeptidase  29.02 
 
 
422 aa  182  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.697451  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0999  aminoacyl-histidine dipeptidase  28.93 
 
 
422 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.738378  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1062  aminoacyl-histidine dipeptidase  28.6 
 
 
422 aa  176  9e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0116  aminoacyl-histidine dipeptidase  29.07 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1073  aminoacyl-histidine dipeptidase  27.88 
 
 
424 aa  173  5e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>