24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0627 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0627  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3326  hypothetical protein  87.42 
 
 		 308 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3673  hypothetical protein  79.03 
 
 		 304 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3140  hypothetical protein  73.23 
 
 		 300 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2354  NERD domain-containing protein  52.13 
 
 		 298 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.941853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2121  hypothetical protein  52.13 
 
 		 298 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.608641  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2107  NERD domain protein  52.13 
 
 		 298 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.661217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2238  hypothetical protein  52.13 
 
 		 298 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.578403  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0784  hypothetical protein  89.52 
 
 		 136 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3797  hypothetical protein  82.41 
 
 		 138 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3205  hypothetical protein  77.48 
 
 		 134 aa  162  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3609  hypothetical protein  30.92 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0788453  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2685  NERD domain-containing protein  30 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00601782  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  30.3 
 
 		 254 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0264  hypothetical protein  26.79 
 
 		 313 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.8207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1095  NERD domain-containing protein  25.48 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00991797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  35.24 
 
 		 540 aa  56.2  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2293  NERD domain protein  27.98 
 
 		 216 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  25.76 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  34.44 
 
 		 263 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  44.23 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3417  NERD domain protein  24.49 
 
 		 275 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.977584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  28.09 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2208  hypothetical protein  24.75 
 
 		 270 aa  42.4  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>