25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0440 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0483  hypothetical protein  94.58 
 
 		 574 aa  1129    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4143  hypothetical protein  96.85 
 
 		 574 aa  1150    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0478  hypothetical protein  94.76 
 
 		 574 aa  1130    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.486321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4059  hypothetical protein  84.09 
 
 		 570 aa  1010    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3512  hypothetical protein  98.96 
 
 		 576 aa  1182    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0440  hypothetical protein  100 
 
 		 576 aa  1190    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3555  hypothetical protein  84.09 
 
 		 570 aa  1006    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.688598  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3689  hypothetical protein  99.13 
 
 		 576 aa  1182    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3179  hypothetical protein  73.66 
 
 		 601 aa  914    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0515  hypothetical protein  86.01 
 
 		 570 aa  1033    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.363208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0459  hypothetical protein  94.58 
 
 		 574 aa  1128    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0760  hypothetical protein  30.18 
 
 		 592 aa  191  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.554801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0776  hypothetical protein  29.98 
 
 		 587 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2199  hypothetical protein  30.84 
 
 		 531 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177322  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1033  hypothetical protein  29.85 
 
 		 488 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1036  hypothetical protein  30 
 
 		 488 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.823153  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2218  hypothetical protein  29.98 
 
 		 575 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000179043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3128  hypothetical protein  30.24 
 
 		 562 aa  169  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0974  hypothetical protein  34.01 
 
 		 488 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3090  hypothetical protein  29.08 
 
 		 538 aa  160  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3633  hypothetical protein  30.12 
 
 		 589 aa  152  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.832641  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2269  hypothetical protein  29.85 
 
 		 515 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1185  hypothetical protein  24.63 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1304  hypothetical protein  25.49 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5229  hypothetical protein  25.28 
 
 		 550 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0780533  normal  0.270928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>