48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0408 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3548  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00713836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0408  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0042697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3722  uroporphyrinogen decarboxylase  98.81 
 
 		 84 aa  169  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.168945  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4196  hypothetical protein  98.78 
 
 		 82 aa  164  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0509  hypothetical protein  91.67 
 
 		 84 aa  158  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0422  uroporphyrinogen decarboxylase  92.86 
 
 		 84 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0434  uroporphyrinogen decarboxylase  92.86 
 
 		 84 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431755  hitchhiker  0.00188375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3892  uroporphyrinogen decarboxylase  92.77 
 
 		 99 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0448  hypothetical protein  92.68 
 
 		 82 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0531  hypothetical protein  79.27 
 
 		 82 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4093  hypothetical protein  80.49 
 
 		 82 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3199  hypothetical protein  78.05 
 
 		 82 aa  134  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3369  hypothetical protein  82.67 
 
 		 84 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.926269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3789  hypothetical protein  82.67 
 
 		 83 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0478  hypothetical protein  71.95 
 
 		 82 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0464  hypothetical protein  73.17 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000325  hypothetical protein  58.33 
 
 		 81 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.681006  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06129  uroporphyrinogen decarboxylase  56.94 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0681  hypothetical protein  54.05 
 
 		 83 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.657209  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3007  hypothetical protein  57.53 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0169292  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1069  hypothetical protein  56.52 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3393  hypothetical protein  60.61 
 
 		 80 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3091  hypothetical protein  56.25 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3030  hypothetical protein  53.33 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0944  hypothetical protein  53.95 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.225877  normal  0.316491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0907  hypothetical protein  53.95 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2943  hypothetical protein  56.16 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0587725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3469  hypothetical protein  54.79 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.652617  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3592  hypothetical protein  54.79 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0637  hypothetical protein  53.95 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0562  hypothetical protein  53.42 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0893  hypothetical protein  54.79 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3882  hypothetical protein  51.22 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.75792  hitchhiker  0.00000229094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3680  hypothetical protein  53.42 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3941  hypothetical protein  59.09 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.941629  normal  0.273389 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2460  hypothetical protein  44.74 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.66442  normal  0.0198742 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3191  hypothetical protein  52.05 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107288  normal  0.334756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2866  hypothetical protein  49.28 
 
 		 207 aa  70.5  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2505  hypothetical protein  48.44 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.279612  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3138  hypothetical protein  41.18 
 
 		 210 aa  64.3  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000486476  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0772  uroporphyrinogen decarboxylase  42.25 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01580  hypothetical protein  40.62 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.577679  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2045  hypothetical protein  34.72 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1894  hypothetical protein  33.78 
 
 		 207 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510303  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2172  hypothetical protein  39.44 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.722768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3130  hypothetical protein  26.39 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1903  hypothetical protein  37.5 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0942609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0223  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>