63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1949 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2027    97.23 
 
 		 505 bp  890    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1194  normal  0.287327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1949    100 
 
 		 609 bp  1207    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276274  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  85.27 
 
 		 924 bp  454  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  85.27 
 
 		 924 bp  454  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  85.27 
 
 		 924 bp  454  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  85.1 
 
 		 924 bp  446  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  85.1 
 
 		 924 bp  446  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  85.1 
 
 		 924 bp  446  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  85.1 
 
 		 924 bp  446  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  84.92 
 
 		 924 bp  438  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  84.92 
 
 		 924 bp  438  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1621    94.44 
 
 		 748 bp  436  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.187393  normal  0.334056 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  84.78 
 
 		 924 bp  432  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  84.78 
 
 		 924 bp  432  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  84.78 
 
 		 924 bp  432  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4183    84.78 
 
 		 1679 bp  432  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  84.78 
 
 		 924 bp  432  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  84.41 
 
 		 924 bp  410  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  84.08 
 
 		 924 bp  400  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  84.08 
 
 		 924 bp  400  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  83.91 
 
 		 924 bp  392  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  83.74 
 
 		 924 bp  385  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  83.74 
 
 		 924 bp  385  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  83.74 
 
 		 924 bp  385  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  83.74 
 
 		 924 bp  385  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  83.56 
 
 		 924 bp  377  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1939    83.39 
 
 		 924 bp  369  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.7341  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  83.39 
 
 		 924 bp  369  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  86.45 
 
 		 432 bp  361  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  83.22 
 
 		 924 bp  361  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2137    82.87 
 
 		 923 bp  337  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00245844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  86.25 
 
 		 387 bp  323  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  84.73 
 
 		 789 bp  295  8e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0583    83.2 
 
 		 834 bp  246  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0614    83.2 
 
 		 857 bp  246  6e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0610  transposase, IS4 family protein  83.44 
 
 		 336 bp  210  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  83.89 
 
 		 597 bp  141  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  84.57 
 
 		 516 bp  115  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2007    88.89 
 
 		 111 bp  109  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0239127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0135    84 
 
 		 707 bp  71.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01493  hypothetical protein  90.74 
 
 		 123 bp  67.9  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  95.12 
 
 		 921 bp  65.9  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  95.12 
 
 		 921 bp  65.9  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  88.14 
 
 		 921 bp  61.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  92.68 
 
 		 921 bp  58  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  92.68 
 
 		 921 bp  58  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  92.68 
 
 		 921 bp  58  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  92.68 
 
 		 921 bp  58  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  92.68 
 
 		 921 bp  58  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  92.68 
 
 		 921 bp  58  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  92.68 
 
 		 921 bp  58  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  92.68 
 
 		 663 bp  58  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  92.68 
 
 		 399 bp  58  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  92.68 
 
 		 921 bp  58  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  92.68 
 
 		 399 bp  58  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  94.29 
 
 		 921 bp  54  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  94.29 
 
 		 921 bp  54  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  86.44 
 
 		 921 bp  54  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  94.29 
 
 		 921 bp  54  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  94.29 
 
 		 921 bp  54  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  94.29 
 
 		 531 bp  54  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  94.29 
 
 		 531 bp  54  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05450  hypothetical protein  87.5 
 
 		 141 bp  48.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>