174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2514 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1785  glucan biosynthesis protein D  81.77 
 
 
531 aa  898    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000307117  hitchhiker  0.00000000192926 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2731  glucan biosynthesis protein G  90.53 
 
 
528 aa  994    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2353  glucan biosynthesis protein G  93.74 
 
 
527 aa  1026    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0646222  hitchhiker  0.0000000102725 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2425  glucan biosynthesis protein G  93.36 
 
 
527 aa  1021    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750815  hitchhiker  0.00489845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1302  glucan biosynthesis protein G  60.2 
 
 
530 aa  659    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2514  glucan biosynthesis protein G  100 
 
 
526 aa  1088    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0712053  hitchhiker  0.00000000245442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2559  glucan biosynthesis protein G  87.84 
 
 
529 aa  887    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000572513  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2336  glucan biosynthesis protein G  84.56 
 
 
529 aa  936    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2597  glucan biosynthesis protein D  87.66 
 
 
529 aa  887    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000617652  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2674  glucan biosynthesis protein D  82.32 
 
 
527 aa  894    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0237308  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3126  glucan biosynthesis protein G  62.61 
 
 
525 aa  633  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.213498  normal  0.0516686 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  42.77 
 
 
559 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  43.3 
 
 
540 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  43.22 
 
 
545 aa  395  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  42.6 
 
 
498 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  42.65 
 
 
545 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  42.65 
 
 
545 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  42.19 
 
 
545 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  41.72 
 
 
542 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  42.47 
 
 
542 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  41.88 
 
 
544 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  42.47 
 
 
542 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  41.72 
 
 
542 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  40.92 
 
 
503 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  40.43 
 
 
495 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  41.63 
 
 
503 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  40.55 
 
 
519 aa  364  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  40.33 
 
 
534 aa  364  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  40.29 
 
 
498 aa  363  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1534  glucan biosynthesis protein G  40.67 
 
 
508 aa  361  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3200  glucan biosynthesis protein G  38.67 
 
 
504 aa  348  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421618  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  38.15 
 
 
546 aa  345  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  39.92 
 
 
542 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  39.31 
 
 
532 aa  343  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1314  glucan biosynthesis protein G  38.51 
 
 
532 aa  341  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327506  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1583  glucan biosynthesis protein G  38.51 
 
 
532 aa  341  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00561497 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  37.09 
 
 
522 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2046  glucan biosynthesis protein G  39.07 
 
 
539 aa  340  5e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324147  normal  0.558823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2321  glucan biosynthesis protein G  39.31 
 
 
539 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  0.314726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  37.63 
 
 
568 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  38.87 
 
 
528 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  37.2 
 
 
505 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  38.16 
 
 
597 aa  333  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  37.55 
 
 
604 aa  333  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  37.18 
 
 
608 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  37.55 
 
 
604 aa  333  5e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  37.55 
 
 
558 aa  333  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  37.18 
 
 
562 aa  333  6e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  37.18 
 
 
562 aa  333  6e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  37.18 
 
 
562 aa  333  6e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  39.01 
 
 
545 aa  331  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  42.36 
 
 
642 aa  329  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5162  periplasmic glucan biosynthesis protein  42.61 
 
 
641 aa  329  7e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  36.38 
 
 
588 aa  329  7e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  37.42 
 
 
533 aa  329  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  37.78 
 
 
522 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  37.12 
 
 
525 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  37.12 
 
 
525 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  36.31 
 
 
594 aa  326  5e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  38.04 
 
 
528 aa  326  7e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  38.04 
 
 
511 aa  326  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0439  glucan biosynthesis protein G  39.33 
 
 
579 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529505  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  40.37 
 
 
519 aa  323  6e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  38.36 
 
 
579 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  38.91 
 
 
559 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  37.5 
 
 
525 aa  320  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5076  glucan biosynthesis protein G  38.36 
 
 
559 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  36.59 
 
 
522 aa  320  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2580  glucan biosynthesis protein D  35.45 
 
 
529 aa  320  5e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1081  glucan biosynthesis protein G  37.76 
 
 
533 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.418062  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  35.28 
 
 
522 aa  318  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1158  glucan biosynthesis protein G  36.28 
 
 
527 aa  317  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  35.14 
 
 
517 aa  317  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  37.01 
 
 
522 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  36.29 
 
 
517 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  36.29 
 
 
517 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  36.29 
 
 
517 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  36.29 
 
 
517 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  36.29 
 
 
517 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  36.64 
 
 
533 aa  315  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  36.68 
 
 
511 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  36.68 
 
 
517 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  35.63 
 
 
530 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  37.22 
 
 
511 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  37.22 
 
 
517 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  36.81 
 
 
522 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  36.68 
 
 
511 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  37.22 
 
 
517 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  37.22 
 
 
511 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  37.22 
 
 
511 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  37.22 
 
 
511 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1670  glucan biosynthesis protein G  36.8 
 
 
498 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  36.23 
 
 
540 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  39.3 
 
 
604 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0125  glucan biosynthesis protein G  35.67 
 
 
540 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1762  glucan biosynthesis protein G  35.67 
 
 
540 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  38.09 
 
 
530 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  38.09 
 
 
520 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1804  glucan biosynthesis protein D  33.96 
 
 
536 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  36.47 
 
 
532 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>