37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1946 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2033  hypothetical protein  57.37 
 
 		 620 aa  679    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461575  hitchhiker  0.0000553349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2437  hypothetical protein  68.88 
 
 		 631 aa  856    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2031  response regulator receiver protein  58 
 
 		 620 aa  680    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1946  response regulator receiver protein  100 
 
 		 646 aa  1313    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2430  response regulator receiver protein  56.8 
 
 		 619 aa  664    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2314  response regulator receiver protein  56.8 
 
 		 619 aa  664    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1891  hypothetical protein  90.56 
 
 		 635 aa  1139    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.724529 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2087  hypothetical protein  91.02 
 
 		 635 aa  1134    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1931  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  53.12 
 
 		 583 aa  595  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2582  response regulator receiver protein  37.66 
 
 		 577 aa  392  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0740866  hitchhiker  0.000257822 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2023  response regulator receiver protein  37.32 
 
 		 582 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2373  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  36.69 
 
 		 580 aa  364  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2086  hypothetical protein  36.17 
 
 		 591 aa  334  4e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.869328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2191  hypothetical protein  35.18 
 
 		 600 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000298084  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1894  hypothetical protein  34.53 
 
 		 583 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.910891  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1850  hypothetical protein  29.7 
 
 		 554 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.543722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3306  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.94 
 
 		 711 aa  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.71 
 
 		 716 aa  49.7  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  28.66 
 
 		 716 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  29.27 
 
 		 716 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.1 
 
 		 714 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  28.05 
 
 		 716 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.1 
 
 		 714 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  28.66 
 
 		 716 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  37.1 
 
 		 714 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.1 
 
 		 714 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.1 
 
 		 715 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1592  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.1 
 
 		 715 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1525  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.1 
 
 		 715 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03135  oligopeptidase A  32.48 
 
 		 674 aa  45.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  28.48 
 
 		 716 aa  45.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.48 
 
 		 714 aa  45.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.99 
 
 		 711 aa  45.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  29.09 
 
 		 716 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  29.09 
 
 		 716 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  29.09 
 
 		 716 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.1 
 
 		 718 aa  44.3  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>