33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3696 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3696  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  100 
 
 		 338 aa  696    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0114  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  78.31 
 
 		 352 aa  553  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3931  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  72.21 
 
 		 352 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0113  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  29.37 
 
 		 594 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4279  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  22.52 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898994 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2237  hypothetical protein  25.64 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.720751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4334  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  22.07 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3894  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  24.42 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4474  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  22.52 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4098  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  24.42 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333921 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4680  hypothetical protein  23.96 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0052  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  22.03 
 
 		 357 aa  53.5  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4156  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  26.48 
 
 		 364 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.188522  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1212  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  30.34 
 
 		 946 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.333736  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0114  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  24.29 
 
 		 351 aa  50.4  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00033  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  26.34 
 
 		 298 aa  49.3  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00158752  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2416  hypothetical protein  25.12 
 
 		 407 aa  49.3  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.256887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3424  hypothetical protein  25.25 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0286769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 1759 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1694 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27860  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  26.67 
 
 		 546 aa  46.6  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4206  CDP-glycerol:Poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase family protein  28.25 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1574  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  27.31 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178333  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3544  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  28.57 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0258  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.83 
 
 		 814 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1690  hypothetical protein  24.77 
 
 		 389 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1805  hypothetical protein  24.62 
 
 		 410 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1014  Methyltransferase type 11  24.27 
 
 		 1155 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0301  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  25.66 
 
 		 390 aa  43.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  26.11 
 
 		 731 aa  42.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  27.22 
 
 		 729 aa  43.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3376  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 		 814 aa  42.7  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04062  CDP-Glycerol:Poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase family  26.49 
 
 		 351 aa  42.4  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>