47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1014 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1014  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 1155 aa  2394    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5006  hypothetical protein  26.9 
 
 		 390 aa  81.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00509945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3347  hypothetical protein  25.62 
 
 		 402 aa  67.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0578  hypothetical protein  27.44 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  40.35 
 
 		 237 aa  56.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 197 aa  54.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3186  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  27.03 
 
 		 255 aa  53.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  34 
 
 		 353 aa  52.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 353 aa  52.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  37.61 
 
 		 323 aa  52  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  31.37 
 
 		 358 aa  51.6  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2520  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.07 
 
 		 233 aa  50.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.783143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  37.93 
 
 		 237 aa  51.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 262 aa  49.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.29 
 
 		 223 aa  49.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  32.75 
 
 		 341 aa  49.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.33 
 
 		 672 aa  48.9  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  22.47 
 
 		 305 aa  48.9  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 196 aa  48.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.84 
 
 		 277 aa  47.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0807  methyltransferase type 11  46.3 
 
 		 267 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1304  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 246 aa  47.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  33.33 
 
 		 246 aa  47.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 327 aa  47  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1569  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 268 aa  47.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 246 aa  47.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 246 aa  47.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.78 
 
 		 250 aa  46.2  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  25.42 
 
 		 310 aa  46.2  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 237 aa  46.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2351  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 		 270 aa  46.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 276 aa  45.8  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4739  Methyltransferase type 12  28.47 
 
 		 391 aa  45.8  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751981  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 249 aa  45.8  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 225 aa  45.8  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3662  Methyltransferase type 12  28.47 
 
 		 391 aa  45.8  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.563292 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  26.79 
 
 		 298 aa  45.4  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.77 
 
 		 345 aa  45.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 255 aa  45.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1178  methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 186 aa  45.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.140989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  46.94 
 
 		 235 aa  45.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 331 aa  45.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 252 aa  45.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 401 aa  45.1  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0956  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 262 aa  45.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 260 aa  45.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  46.94 
 
 		 252 aa  44.7  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>