20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0778 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0778  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  298  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00149988  hitchhiker  0.00290825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0816  hypothetical protein  65.03 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0982442  hitchhiker  0.0000295001 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3763  hypothetical protein  60.14 
 
 		 145 aa  183  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.000438063 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3659  hypothetical protein  60.84 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.455862  hitchhiker  0.0000000693447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3718  hypothetical protein  60.84 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000313462  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0787  hypothetical protein  60.84 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.223249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3841  hypothetical protein  60.14 
 
 		 144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0018703  hitchhiker  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0679  hypothetical protein  57.34 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000256378  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3987  hypothetical protein  59.15 
 
 		 144 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0651  hypothetical protein  57.34 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429003  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3370  hypothetical protein  55.94 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00382393  hitchhiker  0.00694249 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0652  hypothetical protein  55.94 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.020046  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0534  hypothetical protein  53.85 
 
 		 147 aa  157  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0602  hypothetical protein  51.77 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.024256  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2983  hypothetical protein  51.37 
 
 		 145 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0734  hypothetical protein  60.58 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0223559  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00935  hypothetical protein  30.4 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1946  hypothetical protein  32.54 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000222143  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2310  hypothetical protein  35.96 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004460  hypothetical protein  35.14 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00132167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>