20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0826 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0706  hypothetical protein  74.62 
 
 
541 aa  802    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3316  hypothetical protein  74.81 
 
 
541 aa  801    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3428  hypothetical protein  75.56 
 
 
541 aa  809    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0850  hypothetical protein  74.95 
 
 
542 aa  793    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0826  hypothetical protein  100 
 
 
547 aa  1089    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0861  hypothetical protein  97.07 
 
 
547 aa  1057    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0849  hypothetical protein  97.44 
 
 
547 aa  1060    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.71386 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0488  hypothetical protein  29.33 
 
 
595 aa  190  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3248  hypothetical protein  31.31 
 
 
749 aa  83.2  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0588  hypothetical protein  33.76 
 
 
384 aa  79.7  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3249  ferredoxin-type 4Fe-4S protein  35.87 
 
 
416 aa  62.4  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3251  hypothetical protein  27.63 
 
 
474 aa  57.4  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3250  hypothetical protein  38.71 
 
 
477 aa  53.5  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.627274  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3312  putative lipoprotein  23.87 
 
 
412 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0728256  normal  0.382581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0650  hypothetical protein  31.3 
 
 
472 aa  50.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.630777  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1138  hypothetical protein  31.06 
 
 
538 aa  50.4  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000071313  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1168  hypothetical protein  30.77 
 
 
535 aa  50.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000338543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5193  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  35.38 
 
 
195 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1198  hypothetical protein  25.52 
 
 
482 aa  44.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000167019  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1184  hypothetical protein  28.74 
 
 
639 aa  43.5  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>