17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3250 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3251  hypothetical protein  86.32 
 
 		 474 aa  775    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3250  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  951    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.627274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3248  hypothetical protein  67.29 
 
 		 749 aa  443  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1782  gamma-D-glutamate-meso-diaminopimelate muropeptidase  69.12 
 
 		 559 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.314104  normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3249  ferredoxin-type 4Fe-4S protein  86.19 
 
 		 416 aa  324  3e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2317  hypothetical protein  54.09 
 
 		 465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.89603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0848  hypothetical protein  48.54 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0846  hypothetical protein  42.67 
 
 		 439 aa  126  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2560  hypothetical protein  42.52 
 
 		 407 aa  121  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153155  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0588  hypothetical protein  46.21 
 
 		 384 aa  103  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0849  hypothetical protein  38.71 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0861  hypothetical protein  38.71 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0826  hypothetical protein  38.71 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3316  hypothetical protein  38.71 
 
 		 541 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3428  hypothetical protein  38.1 
 
 		 541 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0706  hypothetical protein  38.71 
 
 		 541 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0850  hypothetical protein  40.32 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>