48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0422 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0434  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 84 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431755  hitchhiker  0.00188375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0422  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 84 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3892  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 99 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0448  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3722  uroporphyrinogen decarboxylase  94.05 
 
 		 84 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.168945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3548  hypothetical protein  92.86 
 
 		 84 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00713836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0408  hypothetical protein  92.86 
 
 		 84 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0042697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0509  hypothetical protein  92.86 
 
 		 84 aa  158  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4196  hypothetical protein  93.9 
 
 		 82 aa  155  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0531  hypothetical protein  79.27 
 
 		 82 aa  137  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3199  hypothetical protein  79.27 
 
 		 82 aa  137  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4093  hypothetical protein  80.49 
 
 		 82 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3789  hypothetical protein  79.27 
 
 		 83 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3369  hypothetical protein  74.39 
 
 		 84 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.926269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0478  hypothetical protein  71.95 
 
 		 82 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0464  hypothetical protein  74.39 
 
 		 84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000325  hypothetical protein  53.16 
 
 		 81 aa  94.4  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.681006  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06129  uroporphyrinogen decarboxylase  52.5 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0681  hypothetical protein  51.32 
 
 		 83 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.657209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3393  hypothetical protein  58.11 
 
 		 80 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3469  hypothetical protein  53.09 
 
 		 80 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.652617  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3592  hypothetical protein  53.09 
 
 		 80 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3007  hypothetical protein  57.53 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0169292  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0893  hypothetical protein  53.09 
 
 		 80 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1069  hypothetical protein  54.17 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0944  hypothetical protein  52.56 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.225877  normal  0.316491 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3030  hypothetical protein  50.63 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0907  hypothetical protein  52.56 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3091  hypothetical protein  53.85 
 
 		 85 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2943  hypothetical protein  56.16 
 
 		 79 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0587725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0637  hypothetical protein  53.25 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0562  hypothetical protein  53.42 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3680  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2460  hypothetical protein  46.05 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.66442  normal  0.0198742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3941  hypothetical protein  59.09 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.941629  normal  0.273389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3882  hypothetical protein  50.67 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.75792  hitchhiker  0.00000229094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3191  hypothetical protein  52.05 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107288  normal  0.334756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2866  hypothetical protein  49.3 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2505  hypothetical protein  48.44 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.279612  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3138  hypothetical protein  39.13 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000486476  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0772  uroporphyrinogen decarboxylase  42.25 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01580  hypothetical protein  43.75 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.577679  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2045  hypothetical protein  33.8 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1894  hypothetical protein  32.43 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510303  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2172  hypothetical protein  38.03 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.722768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1903  hypothetical protein  32.88 
 
 		 207 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0942609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0223  hypothetical protein  32.86 
 
 		 213 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3130  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>