30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_4011 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_4011  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 		 83 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3504  plasmid stable inheritance protein I  45.88 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0165  stable plasmid inheritance protein PemI  50.6 
 
 		 85 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000183667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5125  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.88 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3599  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.68 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0770  PemI-like protein  35.8 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4419  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.33 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5741  antitoxin ChpS  36.36 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5699  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.25 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815302  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3769  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.36 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4477  antitoxin ChpS  36.36 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4793  antitoxin ChpS  36.36 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3377  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.5 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00170089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4702  antitoxin ChpS  36.36 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9912  plasmid stable inheritance protein I  33.33 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01481  suppressor of inhibitory function of ChpB  33.77 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2865  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.62 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0889  SpoVT/AbrB-like  31.33 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4254  hypothetical protein  54.29 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0216195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4160  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.68 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.429167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02628  antitoxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system  32.2 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000289943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4043  antitoxin MazE  32.2 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000354584  normal  0.435382 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02590  hypothetical protein  32.2 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000450519  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3090  antitoxin MazE  32.2 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000278445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2921  antitoxin MazE  32.2 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000204371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0929  antitoxin MazE  32.2 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000171018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3087  antitoxin MazE  32.2 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2927  antitoxin MazE  32.2 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299538  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0905  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.2 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000171203  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3351  putative transcriptional regulator  32.86 
 
 		 239 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00224637  normal  0.467937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>