53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3965 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3965  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  829    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0086  hypothetical protein  66.31 
 
 		 412 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4452  hypothetical protein  60.42 
 
 		 394 aa  481  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4179  hypothetical protein  63.97 
 
 		 403 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4845  hypothetical protein  61.84 
 
 		 395 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3769  hypothetical protein  58.38 
 
 		 383 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0075  hypothetical protein  52.77 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0079  hypothetical protein  38.36 
 
 		 158 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2307  putative esterase  23.5 
 
 		 439 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2109  putative esterase  23.83 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000499047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1819  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0827  putative esterase  22.65 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6036  putative esterase  23.46 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000538936  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2821  putative esterase  23.62 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000598865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2144  putative esterase  24.86 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536761  normal  0.363467 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1563  putative esterase  22.84 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.476528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1530  putative esterase  23.12 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000509673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1813  putative esterase  26.81 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1862  putative esterase  26.45 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2563  putative esterase  21.37 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1518  putative esterase  26.09 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2630  putative esterase  20.26 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2737  putative esterase  20.62 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2437  putative esterase  26.34 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.580514  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3040  putative esterase  24.2 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91008 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2088  putative esterase  29.49 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2349  putative esterase  25.67 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705233  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0619  putative esterase  32.45 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01445  putative esterase  25 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.676403  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2868  cysteine synthase A  22.9 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.965819  normal  0.710891 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4960  putative esterase  22.66 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1514  putative esterase  23.15 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00321061  normal  0.816657 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0737  putative esterase  27.07 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0711  putative esterase  25.12 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000350604  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3025  hypothetical protein  22.68 
 
 		 330 aa  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3542  putative esterase  24.64 
 
 		 412 aa  49.7  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0209702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2146  putative esterase  22.99 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3112  putative esterase  24.88 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127997  normal  0.511793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2182  putative esterase  24.16 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000263766  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1535  putative esterase  24.79 
 
 		 232 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5552  putative esterase  30.7 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.927665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2085  putative esterase  23.12 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3111  putative esterase  26.32 
 
 		 312 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.597643  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0079  hypothetical protein  27.73 
 
 		 298 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0868984  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3504  putative esterase  27.81 
 
 		 405 aa  46.6  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  26.34 
 
 		 286 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6478  esterase  30.7 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1666  putative esterase  21.86 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0598325  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1265  putative esterase  23.55 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3277  putative esterase  22.07 
 
 		 273 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.294344  normal  0.0259177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0696  putative esterase  27.56 
 
 		 304 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.665195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3612  putative esterase  35.53 
 
 		 306 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0832475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4375  putative esterase  33.8 
 
 		 288 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.649215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>