34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3030 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3030  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0565079  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3378  hypothetical protein  45.93 
 
 		 190 aa  130  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1172  hypothetical protein  50.32 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3205  hypothetical protein  47.62 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.824686 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3048  hypothetical protein  47.62 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1171  hypothetical protein  48.41 
 
 		 181 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1242  hypothetical protein  47.77 
 
 		 181 aa  121  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.976813  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1315  hypothetical protein  46.43 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.749821  normal  0.330584 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2708  hypothetical protein  42.77 
 
 		 217 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240374  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3062  hypothetical protein  45.24 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1372  hypothetical protein  39.39 
 
 		 169 aa  91.3  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01680  hypothetical protein  36.53 
 
 		 176 aa  88.6  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1004  hypothetical protein  38.89 
 
 		 178 aa  84.7  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0871  membrane protein  32.91 
 
 		 177 aa  84  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.607811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2771  hypothetical protein  34.76 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403966  normal  0.41413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0817  hypothetical protein  33.12 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3176  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0955  hypothetical protein  37.18 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1115  hypothetical protein  34.39 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4742  hypothetical protein  40.74 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.593636  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3020  hypothetical protein  35.03 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1834  hypothetical protein  30.64 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4069  hypothetical protein  29.52 
 
 		 171 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1485  hypothetical protein  30.43 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2330  hypothetical protein  30.82 
 
 		 171 aa  51.6  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0125  hypothetical protein  32.92 
 
 		 177 aa  51.2  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5848  hypothetical protein  25.79 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6579  hypothetical protein  30.6 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0641  hypothetical protein  31.15 
 
 		 179 aa  48.1  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0191113  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2733  hypothetical protein  34 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0770858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01819  hypothetical protein  31.75 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1065  hypothetical protein  34.21 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2465  hypothetical protein  27.39 
 
 		 185 aa  42  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>