14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1975 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1975  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3435  hypothetical protein  32.22 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0563137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0687  hypothetical protein  37.31 
 
 		 175 aa  87.4  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0657  hypothetical protein  35.82 
 
 		 171 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0751  hypothetical protein  38.4 
 
 		 163 aa  84.7  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3698  hypothetical protein  37.21 
 
 		 179 aa  84.7  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0688  hypothetical protein  35.94 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0700399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0502  hypothetical protein  36.2 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0728  hypothetical protein  35.66 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3638  hypothetical protein  34.19 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0965  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.191535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3914  hypothetical protein  36.43 
 
 		 215 aa  72  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000684  hypothetical protein  38.33 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0941  hypothetical protein  21.79 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0583714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>