28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1152 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1152  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1296  hypothetical protein  61.75 
 
 		 237 aa  255  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1333  hypothetical protein  50 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2954  hypothetical protein  49.72 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  41.7 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1409  hypothetical protein  49.16 
 
 		 210 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3107  hypothetical protein  49.16 
 
 		 210 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.841138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2969  hypothetical protein  49.16 
 
 		 210 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1322  hypothetical protein  41.03 
 
 		 210 aa  188  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  41.03 
 
 		 210 aa  188  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1314  hypothetical protein  40.6 
 
 		 210 aa  187  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  52.1 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2604  hypothetical protein  46.37 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.791394  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  53.66 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3094  hypothetical protein  48.81 
 
 		 208 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  44.57 
 
 		 210 aa  159  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  28.07 
 
 		 222 aa  91.7  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  28.65 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  28.07 
 
 		 212 aa  89.4  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  24.22 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  22.78 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1308  hypothetical protein  22.41 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01189  lipoprotein, putative  26 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.44908  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  26.72 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  22.1 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01190  hypothetical protein  24.48 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01188  hypothetical protein  23.12 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.209565  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1309  hypothetical protein  24.79 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>