50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2793 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2793  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2752  hypothetical protein  99.04 
 
 
222 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2814  hypothetical protein  99.04 
 
 
222 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2707  hypothetical protein  99.04 
 
 
212 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874677  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2927  hypothetical protein  99.04 
 
 
222 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3032  hypothetical protein  73.68 
 
 
212 aa  330  8e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.199492  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3632  hypothetical protein  57.49 
 
 
222 aa  251  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832359  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0440  hypothetical protein  55.29 
 
 
224 aa  247  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000354485  hitchhiker  0.00000494731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1271  hypothetical protein  55.29 
 
 
224 aa  247  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00860281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1163  hypothetical protein  55.29 
 
 
224 aa  247  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000035271  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1233  protein of unknown function DUF1007  58.64 
 
 
202 aa  242  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1095  protein of unknown function DUF1007  55.34 
 
 
220 aa  239  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3042  hypothetical protein  56.31 
 
 
219 aa  239  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2760  protein of unknown function DUF1007  53.88 
 
 
220 aa  231  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1080  hypothetical protein  32.37 
 
 
213 aa  131  6e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1975  putative lipoprotein  32.24 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2975  protein of unknown function DUF1007  32.7 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0675  protein of unknown function DUF1007  29.29 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.019732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2774  hypothetical protein  27.64 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3809  hypothetical protein  25.89 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2375  protein of unknown function DUF1007  25 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18361 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2906  hypothetical protein  26.44 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3209  hypothetical protein  28.14 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  26.64 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2332  hypothetical protein  27.92 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0375324  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0097  hypothetical protein  24.77 
 
 
234 aa  62.8  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0089  hypothetical protein  24.77 
 
 
234 aa  62.8  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  29.01 
 
 
197 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2203  hypothetical protein  27.27 
 
 
224 aa  61.6  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0980814  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0392  hypothetical protein  25.48 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0855106  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2246  hypothetical protein  27.27 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5057  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0859  hypothetical protein  25.82 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0941  protein of unknown function DUF1007  24.66 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049615  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4248  hypothetical protein  24.62 
 
 
231 aa  55.1  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2712  hypothetical protein  27.27 
 
 
219 aa  54.7  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1783  protein of unknown function DUF1007  25.13 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1352  hypothetical protein  22.61 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.361884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  24.49 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1399  protein of unknown function DUF1007  23.98 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0330358  normal  0.0597647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1754  hypothetical protein  24.89 
 
 
216 aa  52.4  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  24.49 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4544  hypothetical protein  24.87 
 
 
217 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25009  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1043  protein of unknown function DUF1007  26.84 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3392  protein of unknown function DUF1007  23.36 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0752  protein of unknown function DUF1007  26.17 
 
 
226 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000375765  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5736  protein of unknown function DUF1007  25.45 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4269  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.28 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.655735 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3679  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.928215  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4840  hypothetical protein  23 
 
 
235 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1738  hypothetical protein  25.22 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0927626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>