36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4578 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4578    100 
 
 		 207 bp  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4663    99.52 
 
 		 207 bp  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0356  transposase  96.15 
 
 		 528 bp  341  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  95.67 
 
 		 867 bp  333  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  95.19 
 
 		 867 bp  325  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1239    94.71 
 
 		 540 bp  317  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4878    93.2 
 
 		 534 bp  149  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3157    88.66 
 
 		 468 bp  105  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.749394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  86.52 
 
 		 867 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  86.52 
 
 		 867 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  86.52 
 
 		 867 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2260    86.52 
 
 		 834 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  86.52 
 
 		 867 bp  81.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  86.52 
 
 		 867 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01372    86.52 
 
 		 1163 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282168  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  86.52 
 
 		 897 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02658    86.52 
 
 		 1163 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.404747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  86.52 
 
 		 867 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  86.52 
 
 		 867 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  86.52 
 
 		 867 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  86.52 
 
 		 867 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  86.52 
 
 		 867 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  86.52 
 
 		 867 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  86.52 
 
 		 867 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0079    86.52 
 
 		 868 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1145    86.52 
 
 		 867 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  86.52 
 
 		 867 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  86.52 
 
 		 867 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  86.52 
 
 		 867 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  86.52 
 
 		 867 bp  81.8  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0082    85.39 
 
 		 868 bp  73.8  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0254232  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1773    85.39 
 
 		 868 bp  73.8  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627034  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0198    85.39 
 
 		 641 bp  73.8  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1228    88.41 
 
 		 854 bp  73.8  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4202    86.76 
 
 		 825 bp  63.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0074    88.14 
 
 		 868 bp  61.9  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>