15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3126 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3126  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  384  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5385  hypothetical protein  37.02 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0883057  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5739  hypothetical protein  41.21 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1568  hypothetical protein  31.91 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0567  hypothetical protein  32.97 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.11377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  27.19 
 
 		 223 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3633  PepSY-associated TM helix  27.07 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0987  PepSY-associated TM helix domain protein  29.95 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  26.18 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0430  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.35 
 
 		 211 aa  47.8  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181107  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12400  PepSY-associated TM helix  28.4 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2813  PepSY-associated TM helix  25.68 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0424  PepSY-associated TM helix  24.27 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.906941 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  23.12 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>