74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2233 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2233  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1428  hypothetical protein  74.58 
 
 		 184 aa  286  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1715  hypothetical protein  78.11 
 
 		 183 aa  285  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2635  hypothetical protein  76.3 
 
 		 182 aa  285  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.014875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2568  hypothetical protein  76.3 
 
 		 182 aa  285  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2743  hypothetical protein  75.72 
 
 		 182 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0230588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2825  protein of unknown function DUF1415  71.19 
 
 		 182 aa  276  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1559  hypothetical protein  71.19 
 
 		 182 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3180  hypothetical protein  69.95 
 
 		 189 aa  275  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.588963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1353  hypothetical protein  69.83 
 
 		 180 aa  275  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1526  hypothetical protein  70.62 
 
 		 182 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112476  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1530  hypothetical protein  70.06 
 
 		 182 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2756  hypothetical protein  67.6 
 
 		 188 aa  266  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665194  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1393  hypothetical protein  67.58 
 
 		 186 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0285397 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1492  hypothetical protein  65.59 
 
 		 202 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0122301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1683  hypothetical protein  67.23 
 
 		 191 aa  259  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0614487  unclonable  0.00000199628 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1845  hypothetical protein  60.45 
 
 		 183 aa  236  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2979  hypothetical protein  47.06 
 
 		 195 aa  182  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3140  hypothetical protein  43.35 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0840937  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2192  hypothetical protein  43.5 
 
 		 183 aa  168  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2220  hypothetical protein  44.07 
 
 		 183 aa  167  9e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1157  hypothetical protein  44.51 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.909904  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2030  hypothetical protein  41.81 
 
 		 186 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2881  hypothetical protein  42.53 
 
 		 183 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1556  hypothetical protein  43.31 
 
 		 183 aa  149  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.996386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2224  protein of unknown function DUF1415  37.5 
 
 		 181 aa  142  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.804791  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2114  hypothetical protein  40.22 
 
 		 183 aa  135  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02963  hypothetical protein  37.38 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.058158  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03086  hypothetical protein  37.79 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0293  hypothetical protein  39.38 
 
 		 182 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003684  hypothetical protein  36.97 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1818  protein of unknown function DUF1415  37.36 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0209901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2963  hypothetical protein  39.08 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.351971  normal  0.639812 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02137  hypothetical protein  40 
 
 		 193 aa  121  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3586  hypothetical protein  35.59 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2929  hypothetical protein  36.78 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1040  hypothetical protein  35.03 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3491  protein of unknown function DUF1415  34.97 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.207319 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0429  hypothetical protein  35.59 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1226  hypothetical protein  37.5 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0424  hypothetical protein  36.21 
 
 		 184 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0403  hypothetical protein  35.59 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5572  hypothetical protein  36.84 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0480  hypothetical protein  32.56 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3534  protein of unknown function DUF1415  37.93 
 
 		 194 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0544  hypothetical protein  32.56 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2733  hypothetical protein  35.03 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0471  hypothetical protein  34.29 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2941  hypothetical protein  35.03 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2607  hypothetical protein  34.29 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0498  hypothetical protein  34.29 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595247  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2899  hypothetical protein  33.15 
 
 		 190 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1005  hypothetical protein  34.48 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3616  hypothetical protein  35.03 
 
 		 283 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3604  hypothetical protein  37.2 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3629  hypothetical protein  37.2 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0032  hypothetical protein  36.59 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2809  hypothetical protein  36.59 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3168  hypothetical protein  36.59 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1734  hypothetical protein  36.59 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3518  hypothetical protein  32.73 
 
 		 178 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.0960995 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0870  hypothetical protein  32.77 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0351684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2457  hypothetical protein  34.88 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2989  protein of unknown function DUF1415  35.29 
 
 		 249 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3336  protein of unknown function DUF1415  34.66 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1149  protein of unknown function DUF1415  33.54 
 
 		 191 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3054  hypothetical protein  31.49 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1246  hypothetical protein  32.53 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0706  protein of unknown function DUF1415  29.24 
 
 		 205 aa  89.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36742  predicted protein  29.41 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.905252  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0737  hypothetical protein  31.62 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.60105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45717  predicted protein  27.63 
 
 		 615 aa  55.1  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33635  predicted protein  27.85 
 
 		 170 aa  51.6  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.728091  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5243  hypothetical protein  24.38 
 
 		 244 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>