73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2607 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0498  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2607  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0471  hypothetical protein  98.95 
 
 
190 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3586  hypothetical protein  93.68 
 
 
203 aa  370  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0429  hypothetical protein  93.68 
 
 
190 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0403  hypothetical protein  93.68 
 
 
203 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2899  hypothetical protein  86.32 
 
 
190 aa  344  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815835  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2941  hypothetical protein  78.92 
 
 
247 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3616  hypothetical protein  75.13 
 
 
283 aa  298  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3604  hypothetical protein  75.13 
 
 
207 aa  296  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3629  hypothetical protein  74.6 
 
 
207 aa  295  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1734  hypothetical protein  74.6 
 
 
207 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0032  hypothetical protein  74.6 
 
 
207 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2809  hypothetical protein  74.6 
 
 
207 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3168  hypothetical protein  74.6 
 
 
207 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2733  hypothetical protein  73.08 
 
 
189 aa  290  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3534  protein of unknown function DUF1415  70.95 
 
 
194 aa  275  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0870  hypothetical protein  70.49 
 
 
197 aa  275  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0351684  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0424  hypothetical protein  67.6 
 
 
184 aa  263  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2457  hypothetical protein  75.41 
 
 
196 aa  261  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2114  hypothetical protein  62.57 
 
 
183 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2963  hypothetical protein  60 
 
 
190 aa  221  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.351971  normal  0.639812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3518  hypothetical protein  61.4 
 
 
178 aa  221  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.0960995 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5572  hypothetical protein  57.74 
 
 
206 aa  214  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3491  protein of unknown function DUF1415  57.37 
 
 
188 aa  214  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.207319 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1040  hypothetical protein  60.71 
 
 
201 aa  206  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0480  hypothetical protein  54.34 
 
 
185 aa  206  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1246  hypothetical protein  61.63 
 
 
182 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0544  hypothetical protein  54.34 
 
 
185 aa  204  5e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03086  hypothetical protein  57.47 
 
 
186 aa  204  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2929  hypothetical protein  60 
 
 
206 aa  203  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1005  hypothetical protein  56.14 
 
 
211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1149  protein of unknown function DUF1415  54.74 
 
 
191 aa  188  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0706  protein of unknown function DUF1415  56.55 
 
 
205 aa  187  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2224  protein of unknown function DUF1415  47.73 
 
 
181 aa  170  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.804791  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3336  protein of unknown function DUF1415  56 
 
 
208 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2989  protein of unknown function DUF1415  54.86 
 
 
249 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3054  hypothetical protein  54.24 
 
 
208 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204829 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2881  hypothetical protein  45.76 
 
 
183 aa  165  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0737  hypothetical protein  54.93 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.60105  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1556  hypothetical protein  43.1 
 
 
183 aa  151  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.996386  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1226  hypothetical protein  45 
 
 
182 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2220  hypothetical protein  42.61 
 
 
183 aa  148  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3140  hypothetical protein  38.98 
 
 
186 aa  145  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0840937  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003684  hypothetical protein  40.68 
 
 
190 aa  144  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2192  hypothetical protein  41.48 
 
 
183 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02137  hypothetical protein  39.55 
 
 
193 aa  141  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2030  hypothetical protein  42.68 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1818  protein of unknown function DUF1415  42.86 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0209901  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1157  hypothetical protein  44.58 
 
 
189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.909904  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0293  hypothetical protein  41.57 
 
 
182 aa  136  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1393  hypothetical protein  39.51 
 
 
186 aa  125  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0285397 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1492  hypothetical protein  38.41 
 
 
202 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0122301  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1683  hypothetical protein  38.51 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0614487  unclonable  0.00000199628 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1845  hypothetical protein  35.8 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1526  hypothetical protein  36.14 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112476  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3180  hypothetical protein  35.26 
 
 
189 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.588963  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2825  protein of unknown function DUF1415  36.14 
 
 
182 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101254  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2979  hypothetical protein  35.09 
 
 
195 aa  110  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1559  hypothetical protein  35.54 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02963  hypothetical protein  36.99 
 
 
214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.058158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1530  hypothetical protein  36.14 
 
 
182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2233  hypothetical protein  35.37 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2743  hypothetical protein  36.9 
 
 
182 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0230588  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2635  hypothetical protein  35.71 
 
 
182 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.014875  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2568  hypothetical protein  35.71 
 
 
182 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2756  hypothetical protein  35.8 
 
 
188 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665194  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1715  hypothetical protein  35.54 
 
 
183 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1428  hypothetical protein  35.54 
 
 
184 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1353  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  105  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36742  predicted protein  36.46 
 
 
288 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.905252  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45717  predicted protein  28.73 
 
 
615 aa  73.2  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33635  predicted protein  29.82 
 
 
170 aa  64.3  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.728091  normal  0.688241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>