15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5243 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5243  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  483  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2030  hypothetical protein  29.08 
 
 
186 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1393  hypothetical protein  30.28 
 
 
186 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0285397 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2192  hypothetical protein  19.69 
 
 
183 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2963  hypothetical protein  24.46 
 
 
190 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.351971  normal  0.639812 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2756  hypothetical protein  27.61 
 
 
188 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665194  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2220  hypothetical protein  21.9 
 
 
183 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2233  hypothetical protein  24.84 
 
 
207 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1715  hypothetical protein  22.86 
 
 
183 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2881  hypothetical protein  25.33 
 
 
183 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1428  hypothetical protein  23.53 
 
 
184 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3491  protein of unknown function DUF1415  27.89 
 
 
188 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.207319 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1845  hypothetical protein  25.48 
 
 
183 aa  42.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3518  hypothetical protein  26.18 
 
 
178 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.0960995 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1492  hypothetical protein  24.67 
 
 
202 aa  41.6  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0122301  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>